Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV89

Stxbp4, Syntaxin-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stxbp4Q9WV89 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Stxbp4Q9WV89 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Stxbp4Q9WV89 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Stxbp4Q9WV89 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Stxbp4Q9WV89 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Stxbp4Q9WV89 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Stxbp4Q9WV89 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Stxbp4Q9WV89 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Stxbp4Q9WV89 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Stxbp4Q9WV89 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Stxbp4Q9WV89 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Stxbp4Q9WV89 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Stxbp4Q9WV89 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Stxbp4Q9WV89 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Stxbp4Q9WV89 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Stxbp4Q9WV89 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Stxbp4Q9WV89 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Stxbp4Q9WV89 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Stxbp4Q9WV89 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Stxbp4Q9WV89 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Stxbp4Q9WV89 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Stxbp4Q9WV89 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Stxbp4Q9WV89 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Stxbp4Q9WV89 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Stxbp4Q9WV89 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Stxbp4Q9WV89 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Stxbp4Q9WV89 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Stxbp4Q9WV89 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Stxbp4Q9WV89 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Stxbp4Q9WV89 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Stxbp4Q9WV89 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Stxbp4Q9WV89 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Stxbp4Q9WV89 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Stxbp4Q9WV89 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Stxbp4Q9WV89 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Stxbp4Q9WV89 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Stxbp4Q9WV89 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Stxbp4Q9WV89 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Stxbp4Q9WV89 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Stxbp4Q9WV89 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Stxbp4Q9WV89 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Stxbp4Q9WV89 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Stxbp4Q9WV89 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Stxbp4Q9WV89 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Stxbp4Q9WV89 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Stxbp4Q9WV89 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Stxbp4Q9WV89 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Stxbp4Q9WV89 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Stxbp4Q9WV89 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Stxbp4Q9WV89 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Stxbp4Q9WV89 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Stxbp4Q9WV89 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Stxbp4Q9WV89 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Stxbp4Q9WV89 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Stxbp4Q9WV89 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Stxbp4Q9WV89 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Stxbp4Q9WV89 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Stxbp4Q9WV89 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Stxbp4Q9WV89 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Stxbp4Q9WV89 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Stxbp4Q9WV89 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Stxbp4Q9WV89 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Stxbp4Q9WV89 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Stxbp4Q9WV89 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Stxbp4Q9WV89 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Stxbp4Q9WV89 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Stxbp4Q9WV89 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Stxbp4Q9WV89 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Stxbp4Q9WV89 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Stxbp4Q9WV89 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Stxbp4Q9WV89 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Stxbp4Q9WV89 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Stxbp4Q9WV89 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Stxbp4Q9WV89 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Stxbp4Q9WV89 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Stxbp4Q9WV89 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Stxbp4Q9WV89 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Stxbp4Q9WV89 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Stxbp4Q9WV89 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Stxbp4Q9WV89 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Stxbp4Q9WV89 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Stxbp4Q9WV89 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Stxbp4Q9WV89 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Stxbp4Q9WV89 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Stxbp4Q9WV89 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Stxbp4Q9WV89 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Stxbp4Q9WV89 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Stxbp4Q9WV89 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Stxbp4Q9WV89 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Stxbp4Q9WV89 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Stxbp4Q9WV89 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Stxbp4Q9WV89 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Stxbp4Q9WV89 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Stxbp4Q9WV89 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Stxbp4Q9WV89 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Stxbp4Q9WV89 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Stxbp4Q9WV89 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Stxbp4Q9WV89 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Stxbp4Q9WV89 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Stxbp4Q9WV89 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms