Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV27

Atp1a4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1a4Q9WV27 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atp1a4Q9WV27 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atp1a4Q9WV27 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atp1a4Q9WV27 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atp1a4Q9WV27 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atp1a4Q9WV27 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atp1a4Q9WV27 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Atp1a4Q9WV27 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Atp1a4Q9WV27 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Atp1a4Q9WV27 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Atp1a4Q9WV27 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Atp1a4Q9WV27 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Atp1a4Q9WV27 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Atp1a4Q9WV27 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Atp1a4Q9WV27 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Atp1a4Q9WV27 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Atp1a4Q9WV27 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Atp1a4Q9WV27 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Atp1a4Q9WV27 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Atp1a4Q9WV27 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Atp1a4Q9WV27 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Atp1a4Q9WV27 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Atp1a4Q9WV27 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Atp1a4Q9WV27 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Atp1a4Q9WV27 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Atp1a4Q9WV27 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Atp1a4Q9WV27 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Atp1a4Q9WV27 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Atp1a4Q9WV27 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Atp1a4Q9WV27 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Atp1a4Q9WV27 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Atp1a4Q9WV27 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Atp1a4Q9WV27 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Atp1a4Q9WV27 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Atp1a4Q9WV27 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Atp1a4Q9WV27 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Atp1a4Q9WV27 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Atp1a4Q9WV27 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Atp1a4Q9WV27 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Atp1a4Q9WV27 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Atp1a4Q9WV27 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Atp1a4Q9WV27 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Atp1a4Q9WV27 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atp1a4Q9WV27 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atp1a4Q9WV27 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atp1a4Q9WV27 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atp1a4Q9WV27 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Atp1a4Q9WV27 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Atp1a4Q9WV27 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Atp1a4Q9WV27 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Atp1a4Q9WV27 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Atp1a4Q9WV27 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Atp1a4Q9WV27 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Atp1a4Q9WV27 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Atp1a4Q9WV27 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Atp1a4Q9WV27 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Atp1a4Q9WV27 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Atp1a4Q9WV27 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atp1a4Q9WV27 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atp1a4Q9WV27 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atp1a4Q9WV27 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atp1a4Q9WV27 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atp1a4Q9WV27 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atp1a4Q9WV27 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atp1a4Q9WV27 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atp1a4Q9WV27 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atp1a4Q9WV27 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atp1a4Q9WV27 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atp1a4Q9WV27 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atp1a4Q9WV27 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atp1a4Q9WV27 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atp1a4Q9WV27 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Atp1a4Q9WV27 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atp1a4Q9WV27 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atp1a4Q9WV27 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atp1a4Q9WV27 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atp1a4Q9WV27 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atp1a4Q9WV27 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Atp1a4Q9WV27 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atp1a4Q9WV27 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Atp1a4Q9WV27 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atp1a4Q9WV27 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Atp1a4Q9WV27 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atp1a4Q9WV27 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atp1a4Q9WV27 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atp1a4Q9WV27 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atp1a4Q9WV27 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atp1a4Q9WV27 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Atp1a4Q9WV27 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atp1a4Q9WV27 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atp1a4Q9WV27 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Atp1a4Q9WV27 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atp1a4Q9WV27 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atp1a4Q9WV27 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Atp1a4Q9WV27 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atp1a4Q9WV27 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Atp1a4Q9WV27 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atp1a4Q9WV27 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atp1a4Q9WV27 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atp1a4Q9WV27 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms