Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUK7

Opn3, Opsin-3, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn3Q9WUK7 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Opn3Q9WUK7 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Opn3Q9WUK7 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Opn3Q9WUK7 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Opn3Q9WUK7 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Opn3Q9WUK7 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Opn3Q9WUK7 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Opn3Q9WUK7 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Opn3Q9WUK7 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Opn3Q9WUK7 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Opn3Q9WUK7 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Opn3Q9WUK7 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Opn3Q9WUK7 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Opn3Q9WUK7 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Opn3Q9WUK7 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Opn3Q9WUK7 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Opn3Q9WUK7 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Opn3Q9WUK7 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Opn3Q9WUK7 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Opn3Q9WUK7 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Opn3Q9WUK7 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Opn3Q9WUK7 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Opn3Q9WUK7 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Opn3Q9WUK7 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Opn3Q9WUK7 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Opn3Q9WUK7 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Opn3Q9WUK7 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Opn3Q9WUK7 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Opn3Q9WUK7 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Opn3Q9WUK7 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Opn3Q9WUK7 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Opn3Q9WUK7 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Opn3Q9WUK7 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Opn3Q9WUK7 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Opn3Q9WUK7 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Opn3Q9WUK7 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Opn3Q9WUK7 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Opn3Q9WUK7 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Opn3Q9WUK7 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Opn3Q9WUK7 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Opn3Q9WUK7 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Opn3Q9WUK7 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Opn3Q9WUK7 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Opn3Q9WUK7 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Opn3Q9WUK7 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Opn3Q9WUK7 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Opn3Q9WUK7 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Opn3Q9WUK7 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Opn3Q9WUK7 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Opn3Q9WUK7 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Opn3Q9WUK7 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Opn3Q9WUK7 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Opn3Q9WUK7 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Opn3Q9WUK7 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Opn3Q9WUK7 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Opn3Q9WUK7 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Opn3Q9WUK7 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Opn3Q9WUK7 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Opn3Q9WUK7 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Opn3Q9WUK7 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Opn3Q9WUK7 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Opn3Q9WUK7 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Opn3Q9WUK7 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Opn3Q9WUK7 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Opn3Q9WUK7 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Opn3Q9WUK7 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Opn3Q9WUK7 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Opn3Q9WUK7 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Opn3Q9WUK7 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Opn3Q9WUK7 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Opn3Q9WUK7 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Opn3Q9WUK7 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Opn3Q9WUK7 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Opn3Q9WUK7 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Opn3Q9WUK7 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Opn3Q9WUK7 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Opn3Q9WUK7 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Opn3Q9WUK7 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Opn3Q9WUK7 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Opn3Q9WUK7 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Opn3Q9WUK7 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Opn3Q9WUK7 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Opn3Q9WUK7 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Opn3Q9WUK7 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Opn3Q9WUK7 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Opn3Q9WUK7 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Opn3Q9WUK7 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Opn3Q9WUK7 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Opn3Q9WUK7 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Opn3Q9WUK7 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Opn3Q9WUK7 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Opn3Q9WUK7 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Opn3Q9WUK7 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Opn3Q9WUK7 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Opn3Q9WUK7 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Opn3Q9WUK7 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Opn3Q9WUK7 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Opn3Q9WUK7 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Opn3Q9WUK7 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Opn3Q9WUK7 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms