Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUI0

Mixl1, Homeobox protein MIXL1, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mixl1Q9WUI0 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mixl1Q9WUI0 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mixl1Q9WUI0 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mixl1Q9WUI0 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mixl1Q9WUI0 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mixl1Q9WUI0 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mixl1Q9WUI0 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mixl1Q9WUI0 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Mixl1Q9WUI0 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mixl1Q9WUI0 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mixl1Q9WUI0 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mixl1Q9WUI0 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mixl1Q9WUI0 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mixl1Q9WUI0 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mixl1Q9WUI0 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mixl1Q9WUI0 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mixl1Q9WUI0 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mixl1Q9WUI0 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mixl1Q9WUI0 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mixl1Q9WUI0 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mixl1Q9WUI0 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mixl1Q9WUI0 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mixl1Q9WUI0 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mixl1Q9WUI0 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mixl1Q9WUI0 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mixl1Q9WUI0 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mixl1Q9WUI0 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mixl1Q9WUI0 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mixl1Q9WUI0 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mixl1Q9WUI0 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mixl1Q9WUI0 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mixl1Q9WUI0 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mixl1Q9WUI0 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Mixl1Q9WUI0 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Mixl1Q9WUI0 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mixl1Q9WUI0 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mixl1Q9WUI0 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mixl1Q9WUI0 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mixl1Q9WUI0 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mixl1Q9WUI0 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mixl1Q9WUI0 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mixl1Q9WUI0 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mixl1Q9WUI0 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mixl1Q9WUI0 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mixl1Q9WUI0 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mixl1Q9WUI0 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Mixl1Q9WUI0 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mixl1Q9WUI0 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mixl1Q9WUI0 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mixl1Q9WUI0 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mixl1Q9WUI0 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mixl1Q9WUI0 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mixl1Q9WUI0 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mixl1Q9WUI0 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mixl1Q9WUI0 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mixl1Q9WUI0 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mixl1Q9WUI0 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mixl1Q9WUI0 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mixl1Q9WUI0 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mixl1Q9WUI0 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mixl1Q9WUI0 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mixl1Q9WUI0 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Mixl1Q9WUI0 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Mixl1Q9WUI0 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Mixl1Q9WUI0 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Mixl1Q9WUI0 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Mixl1Q9WUI0 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Mixl1Q9WUI0 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Mixl1Q9WUI0 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mixl1Q9WUI0 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mixl1Q9WUI0 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mixl1Q9WUI0 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mixl1Q9WUI0 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mixl1Q9WUI0 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mixl1Q9WUI0 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mixl1Q9WUI0 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mixl1Q9WUI0 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mixl1Q9WUI0 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mixl1Q9WUI0 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mixl1Q9WUI0 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mixl1Q9WUI0 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mixl1Q9WUI0 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mixl1Q9WUI0 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mixl1Q9WUI0 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mixl1Q9WUI0 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mixl1Q9WUI0 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mixl1Q9WUI0 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mixl1Q9WUI0 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mixl1Q9WUI0 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Mixl1Q9WUI0 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mixl1Q9WUI0 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mixl1Q9WUI0 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mixl1Q9WUI0 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mixl1Q9WUI0 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mixl1Q9WUI0 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mixl1Q9WUI0 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mixl1Q9WUI0 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mixl1Q9WUI0 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Mixl1Q9WUI0 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mixl1Q9WUI0 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms