Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU78

Pdcd6ip, Programmed cell death 6-interacting protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 869 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd6ipQ9WU78 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pdcd6ipQ9WU78 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pdcd6ipQ9WU78 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pdcd6ipQ9WU78 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Pdcd6ipQ9WU78 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pdcd6ipQ9WU78 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pdcd6ipQ9WU78 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pdcd6ipQ9WU78 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pdcd6ipQ9WU78 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Pdcd6ipQ9WU78 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pdcd6ipQ9WU78 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pdcd6ipQ9WU78 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pdcd6ipQ9WU78 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pdcd6ipQ9WU78 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pdcd6ipQ9WU78 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pdcd6ipQ9WU78 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pdcd6ipQ9WU78 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pdcd6ipQ9WU78 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pdcd6ipQ9WU78 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pdcd6ipQ9WU78 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pdcd6ipQ9WU78 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pdcd6ipQ9WU78 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pdcd6ipQ9WU78 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pdcd6ipQ9WU78 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pdcd6ipQ9WU78 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Pdcd6ipQ9WU78 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pdcd6ipQ9WU78 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pdcd6ipQ9WU78 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pdcd6ipQ9WU78 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pdcd6ipQ9WU78 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pdcd6ipQ9WU78 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pdcd6ipQ9WU78 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pdcd6ipQ9WU78 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pdcd6ipQ9WU78 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pdcd6ipQ9WU78 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pdcd6ipQ9WU78 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pdcd6ipQ9WU78 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Pdcd6ipQ9WU78 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pdcd6ipQ9WU78 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pdcd6ipQ9WU78 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pdcd6ipQ9WU78 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pdcd6ipQ9WU78 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pdcd6ipQ9WU78 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pdcd6ipQ9WU78 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pdcd6ipQ9WU78 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Pdcd6ipQ9WU78 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pdcd6ipQ9WU78 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pdcd6ipQ9WU78 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pdcd6ipQ9WU78 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Pdcd6ipQ9WU78 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pdcd6ipQ9WU78 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pdcd6ipQ9WU78 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pdcd6ipQ9WU78 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pdcd6ipQ9WU78 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pdcd6ipQ9WU78 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pdcd6ipQ9WU78 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pdcd6ipQ9WU78 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pdcd6ipQ9WU78 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pdcd6ipQ9WU78 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pdcd6ipQ9WU78 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pdcd6ipQ9WU78 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pdcd6ipQ9WU78 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pdcd6ipQ9WU78 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pdcd6ipQ9WU78 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Pdcd6ipQ9WU78 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pdcd6ipQ9WU78 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pdcd6ipQ9WU78 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pdcd6ipQ9WU78 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pdcd6ipQ9WU78 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pdcd6ipQ9WU78 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pdcd6ipQ9WU78 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pdcd6ipQ9WU78 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pdcd6ipQ9WU78 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pdcd6ipQ9WU78 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pdcd6ipQ9WU78 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pdcd6ipQ9WU78 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pdcd6ipQ9WU78 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pdcd6ipQ9WU78 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pdcd6ipQ9WU78 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pdcd6ipQ9WU78 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pdcd6ipQ9WU78 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pdcd6ipQ9WU78 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pdcd6ipQ9WU78 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pdcd6ipQ9WU78 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pdcd6ipQ9WU78 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pdcd6ipQ9WU78 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pdcd6ipQ9WU78 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pdcd6ipQ9WU78 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pdcd6ipQ9WU78 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pdcd6ipQ9WU78 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pdcd6ipQ9WU78 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pdcd6ipQ9WU78 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pdcd6ipQ9WU78 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pdcd6ipQ9WU78 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pdcd6ipQ9WU78 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pdcd6ipQ9WU78 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pdcd6ipQ9WU78 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pdcd6ipQ9WU78 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pdcd6ipQ9WU78 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pdcd6ipQ9WU78 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms