Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU40

Lemd3, Inner nuclear membrane protein Man1, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lemd3Q9WU40 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Lemd3Q9WU40 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Lemd3Q9WU40 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Lemd3Q9WU40 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Lemd3Q9WU40 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Lemd3Q9WU40 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Lemd3Q9WU40 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Lemd3Q9WU40 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Lemd3Q9WU40 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Lemd3Q9WU40 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Lemd3Q9WU40 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Lemd3Q9WU40 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Lemd3Q9WU40 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Lemd3Q9WU40 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Lemd3Q9WU40 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Lemd3Q9WU40 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Lemd3Q9WU40 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Lemd3Q9WU40 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Lemd3Q9WU40 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Lemd3Q9WU40 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Lemd3Q9WU40 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Lemd3Q9WU40 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Lemd3Q9WU40 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Lemd3Q9WU40 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Lemd3Q9WU40 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Lemd3Q9WU40 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Lemd3Q9WU40 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Lemd3Q9WU40 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Lemd3Q9WU40 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Lemd3Q9WU40 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Lemd3Q9WU40 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Lemd3Q9WU40 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Lemd3Q9WU40 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Lemd3Q9WU40 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Lemd3Q9WU40 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Lemd3Q9WU40 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Lemd3Q9WU40 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Lemd3Q9WU40 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Lemd3Q9WU40 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Lemd3Q9WU40 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Lemd3Q9WU40 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Lemd3Q9WU40 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Lemd3Q9WU40 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Lemd3Q9WU40 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Lemd3Q9WU40 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Lemd3Q9WU40 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Lemd3Q9WU40 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Lemd3Q9WU40 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Lemd3Q9WU40 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Lemd3Q9WU40 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Lemd3Q9WU40 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Lemd3Q9WU40 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Lemd3Q9WU40 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Lemd3Q9WU40 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Lemd3Q9WU40 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Lemd3Q9WU40 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Lemd3Q9WU40 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Lemd3Q9WU40 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Lemd3Q9WU40 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Lemd3Q9WU40 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Lemd3Q9WU40 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Lemd3Q9WU40 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Lemd3Q9WU40 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Lemd3Q9WU40 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Lemd3Q9WU40 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Lemd3Q9WU40 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Lemd3Q9WU40 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Lemd3Q9WU40 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Lemd3Q9WU40 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Lemd3Q9WU40 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Lemd3Q9WU40 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Lemd3Q9WU40 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Lemd3Q9WU40 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Lemd3Q9WU40 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Lemd3Q9WU40 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Lemd3Q9WU40 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Lemd3Q9WU40 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Lemd3Q9WU40 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Lemd3Q9WU40 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Lemd3Q9WU40 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Lemd3Q9WU40 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Lemd3Q9WU40 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Lemd3Q9WU40 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Lemd3Q9WU40 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Lemd3Q9WU40 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Lemd3Q9WU40 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Lemd3Q9WU40 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Lemd3Q9WU40 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Lemd3Q9WU40 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Lemd3Q9WU40 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Lemd3Q9WU40 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Lemd3Q9WU40 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Lemd3Q9WU40 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Lemd3Q9WU40 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Lemd3Q9WU40 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Lemd3Q9WU40 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Lemd3Q9WU40 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Lemd3Q9WU40 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Lemd3Q9WU40 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Lemd3Q9WU40 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms