Protein–RNA interactions for Protein: Q9R269

Ppl, Periplakin, mousemouse

Predictions only

Length 1,755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PplQ9R269 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PplQ9R269 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PplQ9R269 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PplQ9R269 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PplQ9R269 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PplQ9R269 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PplQ9R269 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PplQ9R269 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PplQ9R269 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PplQ9R269 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PplQ9R269 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PplQ9R269 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PplQ9R269 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PplQ9R269 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PplQ9R269 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PplQ9R269 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PplQ9R269 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PplQ9R269 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
PplQ9R269 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
PplQ9R269 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PplQ9R269 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PplQ9R269 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PplQ9R269 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PplQ9R269 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PplQ9R269 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PplQ9R269 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PplQ9R269 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PplQ9R269 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PplQ9R269 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
PplQ9R269 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PplQ9R269 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PplQ9R269 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PplQ9R269 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PplQ9R269 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PplQ9R269 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PplQ9R269 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PplQ9R269 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PplQ9R269 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PplQ9R269 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PplQ9R269 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PplQ9R269 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PplQ9R269 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PplQ9R269 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PplQ9R269 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PplQ9R269 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PplQ9R269 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PplQ9R269 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
PplQ9R269 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PplQ9R269 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
PplQ9R269 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
PplQ9R269 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
PplQ9R269 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PplQ9R269 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PplQ9R269 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PplQ9R269 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PplQ9R269 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
PplQ9R269 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
PplQ9R269 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PplQ9R269 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PplQ9R269 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PplQ9R269 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PplQ9R269 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PplQ9R269 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PplQ9R269 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
PplQ9R269 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
PplQ9R269 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PplQ9R269 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PplQ9R269 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PplQ9R269 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PplQ9R269 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PplQ9R269 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
PplQ9R269 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
PplQ9R269 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
PplQ9R269 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PplQ9R269 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PplQ9R269 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PplQ9R269 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PplQ9R269 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PplQ9R269 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PplQ9R269 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PplQ9R269 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PplQ9R269 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PplQ9R269 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PplQ9R269 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PplQ9R269 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PplQ9R269 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PplQ9R269 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PplQ9R269 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PplQ9R269 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PplQ9R269 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PplQ9R269 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PplQ9R269 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PplQ9R269 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PplQ9R269 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PplQ9R269 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PplQ9R269 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PplQ9R269 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PplQ9R269 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PplQ9R269 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PplQ9R269 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms