Protein–RNA interactions for Protein: Q9R233

Tapbp, Tapasin, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TapbpQ9R233 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TapbpQ9R233 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TapbpQ9R233 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TapbpQ9R233 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TapbpQ9R233 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TapbpQ9R233 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TapbpQ9R233 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TapbpQ9R233 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TapbpQ9R233 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TapbpQ9R233 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TapbpQ9R233 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TapbpQ9R233 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TapbpQ9R233 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TapbpQ9R233 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
TapbpQ9R233 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TapbpQ9R233 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TapbpQ9R233 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TapbpQ9R233 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TapbpQ9R233 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TapbpQ9R233 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TapbpQ9R233 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TapbpQ9R233 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TapbpQ9R233 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TapbpQ9R233 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TapbpQ9R233 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TapbpQ9R233 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TapbpQ9R233 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TapbpQ9R233 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TapbpQ9R233 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TapbpQ9R233 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TapbpQ9R233 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TapbpQ9R233 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TapbpQ9R233 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TapbpQ9R233 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TapbpQ9R233 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TapbpQ9R233 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TapbpQ9R233 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TapbpQ9R233 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TapbpQ9R233 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TapbpQ9R233 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TapbpQ9R233 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TapbpQ9R233 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TapbpQ9R233 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TapbpQ9R233 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TapbpQ9R233 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TapbpQ9R233 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TapbpQ9R233 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TapbpQ9R233 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TapbpQ9R233 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TapbpQ9R233 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TapbpQ9R233 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TapbpQ9R233 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TapbpQ9R233 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TapbpQ9R233 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TapbpQ9R233 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TapbpQ9R233 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TapbpQ9R233 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TapbpQ9R233 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TapbpQ9R233 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TapbpQ9R233 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TapbpQ9R233 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TapbpQ9R233 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TapbpQ9R233 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TapbpQ9R233 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TapbpQ9R233 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TapbpQ9R233 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TapbpQ9R233 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TapbpQ9R233 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TapbpQ9R233 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TapbpQ9R233 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TapbpQ9R233 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TapbpQ9R233 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TapbpQ9R233 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TapbpQ9R233 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TapbpQ9R233 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TapbpQ9R233 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TapbpQ9R233 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TapbpQ9R233 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TapbpQ9R233 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TapbpQ9R233 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TapbpQ9R233 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TapbpQ9R233 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TapbpQ9R233 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TapbpQ9R233 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TapbpQ9R233 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TapbpQ9R233 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TapbpQ9R233 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TapbpQ9R233 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TapbpQ9R233 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TapbpQ9R233 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TapbpQ9R233 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TapbpQ9R233 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TapbpQ9R233 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TapbpQ9R233 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TapbpQ9R233 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TapbpQ9R233 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TapbpQ9R233 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TapbpQ9R233 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TapbpQ9R233 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TapbpQ9R233 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms