Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1X5

Abcc5, Multidrug resistance-associated protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc5Q9R1X5 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Abcc5Q9R1X5 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Abcc5Q9R1X5 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Abcc5Q9R1X5 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Abcc5Q9R1X5 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Abcc5Q9R1X5 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Abcc5Q9R1X5 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Abcc5Q9R1X5 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.12
Abcc5Q9R1X5 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC28.26■■■□□ 2.12
Abcc5Q9R1X5 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.12
Abcc5Q9R1X5 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.12
Abcc5Q9R1X5 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Abcc5Q9R1X5 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
Abcc5Q9R1X5 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Abcc5Q9R1X5 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Abcc5Q9R1X5 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Abcc5Q9R1X5 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Abcc5Q9R1X5 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Abcc5Q9R1X5 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Abcc5Q9R1X5 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Abcc5Q9R1X5 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Abcc5Q9R1X5 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Abcc5Q9R1X5 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Abcc5Q9R1X5 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Abcc5Q9R1X5 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Abcc5Q9R1X5 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Abcc5Q9R1X5 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Abcc5Q9R1X5 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Abcc5Q9R1X5 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Abcc5Q9R1X5 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Abcc5Q9R1X5 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Abcc5Q9R1X5 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Abcc5Q9R1X5 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Abcc5Q9R1X5 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Abcc5Q9R1X5 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Abcc5Q9R1X5 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Abcc5Q9R1X5 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Abcc5Q9R1X5 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Abcc5Q9R1X5 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Abcc5Q9R1X5 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Abcc5Q9R1X5 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Abcc5Q9R1X5 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Abcc5Q9R1X5 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Abcc5Q9R1X5 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Abcc5Q9R1X5 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Abcc5Q9R1X5 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Abcc5Q9R1X5 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Abcc5Q9R1X5 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Abcc5Q9R1X5 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Abcc5Q9R1X5 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Abcc5Q9R1X5 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Abcc5Q9R1X5 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Abcc5Q9R1X5 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Abcc5Q9R1X5 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Abcc5Q9R1X5 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Abcc5Q9R1X5 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Abcc5Q9R1X5 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Abcc5Q9R1X5 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Abcc5Q9R1X5 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Abcc5Q9R1X5 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Abcc5Q9R1X5 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Abcc5Q9R1X5 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Abcc5Q9R1X5 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Abcc5Q9R1X5 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Abcc5Q9R1X5 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Abcc5Q9R1X5 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Abcc5Q9R1X5 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Abcc5Q9R1X5 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Abcc5Q9R1X5 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Abcc5Q9R1X5 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Abcc5Q9R1X5 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Abcc5Q9R1X5 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Abcc5Q9R1X5 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Abcc5Q9R1X5 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Abcc5Q9R1X5 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Abcc5Q9R1X5 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Abcc5Q9R1X5 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Abcc5Q9R1X5 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Abcc5Q9R1X5 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Abcc5Q9R1X5 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Abcc5Q9R1X5 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Abcc5Q9R1X5 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Abcc5Q9R1X5 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Abcc5Q9R1X5 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Abcc5Q9R1X5 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Abcc5Q9R1X5 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Abcc5Q9R1X5 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Abcc5Q9R1X5 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Abcc5Q9R1X5 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Abcc5Q9R1X5 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Abcc5Q9R1X5 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Abcc5Q9R1X5 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Abcc5Q9R1X5 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Abcc5Q9R1X5 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Abcc5Q9R1X5 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Abcc5Q9R1X5 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Abcc5Q9R1X5 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Abcc5Q9R1X5 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Abcc5Q9R1X5 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Abcc5Q9R1X5 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms