Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1A9

Trex2, Three prime repair exonuclease 2, mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trex2Q9R1A9 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Trex2Q9R1A9 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trex2Q9R1A9 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trex2Q9R1A9 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trex2Q9R1A9 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trex2Q9R1A9 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trex2Q9R1A9 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trex2Q9R1A9 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trex2Q9R1A9 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trex2Q9R1A9 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trex2Q9R1A9 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trex2Q9R1A9 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trex2Q9R1A9 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trex2Q9R1A9 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trex2Q9R1A9 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trex2Q9R1A9 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trex2Q9R1A9 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trex2Q9R1A9 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trex2Q9R1A9 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trex2Q9R1A9 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trex2Q9R1A9 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trex2Q9R1A9 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trex2Q9R1A9 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trex2Q9R1A9 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trex2Q9R1A9 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trex2Q9R1A9 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trex2Q9R1A9 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trex2Q9R1A9 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trex2Q9R1A9 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trex2Q9R1A9 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trex2Q9R1A9 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Trex2Q9R1A9 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trex2Q9R1A9 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trex2Q9R1A9 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trex2Q9R1A9 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trex2Q9R1A9 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trex2Q9R1A9 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trex2Q9R1A9 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Trex2Q9R1A9 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trex2Q9R1A9 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trex2Q9R1A9 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trex2Q9R1A9 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trex2Q9R1A9 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trex2Q9R1A9 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trex2Q9R1A9 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trex2Q9R1A9 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trex2Q9R1A9 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trex2Q9R1A9 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Trex2Q9R1A9 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trex2Q9R1A9 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trex2Q9R1A9 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trex2Q9R1A9 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trex2Q9R1A9 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trex2Q9R1A9 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trex2Q9R1A9 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trex2Q9R1A9 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trex2Q9R1A9 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trex2Q9R1A9 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trex2Q9R1A9 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trex2Q9R1A9 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trex2Q9R1A9 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Trex2Q9R1A9 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trex2Q9R1A9 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trex2Q9R1A9 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trex2Q9R1A9 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trex2Q9R1A9 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trex2Q9R1A9 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Trex2Q9R1A9 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trex2Q9R1A9 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trex2Q9R1A9 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trex2Q9R1A9 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trex2Q9R1A9 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trex2Q9R1A9 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trex2Q9R1A9 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trex2Q9R1A9 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trex2Q9R1A9 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trex2Q9R1A9 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trex2Q9R1A9 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trex2Q9R1A9 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trex2Q9R1A9 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Trex2Q9R1A9 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trex2Q9R1A9 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trex2Q9R1A9 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trex2Q9R1A9 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trex2Q9R1A9 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trex2Q9R1A9 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trex2Q9R1A9 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trex2Q9R1A9 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trex2Q9R1A9 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trex2Q9R1A9 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trex2Q9R1A9 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trex2Q9R1A9 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trex2Q9R1A9 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trex2Q9R1A9 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Trex2Q9R1A9 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trex2Q9R1A9 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trex2Q9R1A9 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trex2Q9R1A9 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trex2Q9R1A9 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trex2Q9R1A9 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms