Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1A3

Ntn3, Netrin-3, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ntn3Q9R1A3 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ntn3Q9R1A3 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ntn3Q9R1A3 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ntn3Q9R1A3 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ntn3Q9R1A3 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ntn3Q9R1A3 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ntn3Q9R1A3 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ntn3Q9R1A3 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ntn3Q9R1A3 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ntn3Q9R1A3 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ntn3Q9R1A3 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ntn3Q9R1A3 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ntn3Q9R1A3 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ntn3Q9R1A3 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ntn3Q9R1A3 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ntn3Q9R1A3 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ntn3Q9R1A3 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ntn3Q9R1A3 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ntn3Q9R1A3 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ntn3Q9R1A3 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ntn3Q9R1A3 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ntn3Q9R1A3 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ntn3Q9R1A3 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ntn3Q9R1A3 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ntn3Q9R1A3 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ntn3Q9R1A3 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ntn3Q9R1A3 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ntn3Q9R1A3 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ntn3Q9R1A3 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ntn3Q9R1A3 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ntn3Q9R1A3 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ntn3Q9R1A3 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ntn3Q9R1A3 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ntn3Q9R1A3 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ntn3Q9R1A3 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ntn3Q9R1A3 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ntn3Q9R1A3 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ntn3Q9R1A3 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ntn3Q9R1A3 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ntn3Q9R1A3 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ntn3Q9R1A3 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ntn3Q9R1A3 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ntn3Q9R1A3 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ntn3Q9R1A3 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ntn3Q9R1A3 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ntn3Q9R1A3 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ntn3Q9R1A3 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ntn3Q9R1A3 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ntn3Q9R1A3 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ntn3Q9R1A3 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ntn3Q9R1A3 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ntn3Q9R1A3 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ntn3Q9R1A3 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ntn3Q9R1A3 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ntn3Q9R1A3 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ntn3Q9R1A3 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ntn3Q9R1A3 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ntn3Q9R1A3 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ntn3Q9R1A3 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ntn3Q9R1A3 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ntn3Q9R1A3 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ntn3Q9R1A3 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ntn3Q9R1A3 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ntn3Q9R1A3 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ntn3Q9R1A3 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ntn3Q9R1A3 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ntn3Q9R1A3 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ntn3Q9R1A3 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ntn3Q9R1A3 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ntn3Q9R1A3 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ntn3Q9R1A3 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ntn3Q9R1A3 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ntn3Q9R1A3 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ntn3Q9R1A3 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ntn3Q9R1A3 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ntn3Q9R1A3 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ntn3Q9R1A3 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ntn3Q9R1A3 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ntn3Q9R1A3 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ntn3Q9R1A3 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ntn3Q9R1A3 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ntn3Q9R1A3 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ntn3Q9R1A3 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ntn3Q9R1A3 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ntn3Q9R1A3 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ntn3Q9R1A3 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ntn3Q9R1A3 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ntn3Q9R1A3 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ntn3Q9R1A3 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ntn3Q9R1A3 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ntn3Q9R1A3 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ntn3Q9R1A3 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ntn3Q9R1A3 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ntn3Q9R1A3 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ntn3Q9R1A3 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ntn3Q9R1A3 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ntn3Q9R1A3 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ntn3Q9R1A3 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ntn3Q9R1A3 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ntn3Q9R1A3 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms