Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0Q9

Mpdu1, Mannose-P-dolichol utilization defect 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mpdu1Q9R0Q9 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mpdu1Q9R0Q9 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mpdu1Q9R0Q9 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mpdu1Q9R0Q9 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Mpdu1Q9R0Q9 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Mpdu1Q9R0Q9 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mpdu1Q9R0Q9 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mpdu1Q9R0Q9 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mpdu1Q9R0Q9 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mpdu1Q9R0Q9 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mpdu1Q9R0Q9 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mpdu1Q9R0Q9 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mpdu1Q9R0Q9 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mpdu1Q9R0Q9 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mpdu1Q9R0Q9 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mpdu1Q9R0Q9 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mpdu1Q9R0Q9 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mpdu1Q9R0Q9 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mpdu1Q9R0Q9 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mpdu1Q9R0Q9 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mpdu1Q9R0Q9 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mpdu1Q9R0Q9 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mpdu1Q9R0Q9 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mpdu1Q9R0Q9 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mpdu1Q9R0Q9 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Mpdu1Q9R0Q9 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mpdu1Q9R0Q9 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mpdu1Q9R0Q9 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mpdu1Q9R0Q9 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mpdu1Q9R0Q9 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mpdu1Q9R0Q9 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mpdu1Q9R0Q9 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mpdu1Q9R0Q9 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mpdu1Q9R0Q9 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mpdu1Q9R0Q9 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mpdu1Q9R0Q9 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mpdu1Q9R0Q9 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mpdu1Q9R0Q9 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mpdu1Q9R0Q9 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mpdu1Q9R0Q9 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mpdu1Q9R0Q9 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mpdu1Q9R0Q9 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mpdu1Q9R0Q9 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mpdu1Q9R0Q9 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mpdu1Q9R0Q9 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mpdu1Q9R0Q9 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mpdu1Q9R0Q9 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mpdu1Q9R0Q9 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mpdu1Q9R0Q9 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mpdu1Q9R0Q9 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mpdu1Q9R0Q9 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mpdu1Q9R0Q9 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mpdu1Q9R0Q9 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mpdu1Q9R0Q9 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mpdu1Q9R0Q9 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mpdu1Q9R0Q9 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mpdu1Q9R0Q9 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mpdu1Q9R0Q9 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mpdu1Q9R0Q9 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mpdu1Q9R0Q9 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mpdu1Q9R0Q9 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mpdu1Q9R0Q9 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Mpdu1Q9R0Q9 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mpdu1Q9R0Q9 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mpdu1Q9R0Q9 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mpdu1Q9R0Q9 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mpdu1Q9R0Q9 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mpdu1Q9R0Q9 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mpdu1Q9R0Q9 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mpdu1Q9R0Q9 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mpdu1Q9R0Q9 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mpdu1Q9R0Q9 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mpdu1Q9R0Q9 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mpdu1Q9R0Q9 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mpdu1Q9R0Q9 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mpdu1Q9R0Q9 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mpdu1Q9R0Q9 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mpdu1Q9R0Q9 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mpdu1Q9R0Q9 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mpdu1Q9R0Q9 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mpdu1Q9R0Q9 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mpdu1Q9R0Q9 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mpdu1Q9R0Q9 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mpdu1Q9R0Q9 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mpdu1Q9R0Q9 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Mpdu1Q9R0Q9 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Mpdu1Q9R0Q9 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Mpdu1Q9R0Q9 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mpdu1Q9R0Q9 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mpdu1Q9R0Q9 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mpdu1Q9R0Q9 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mpdu1Q9R0Q9 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mpdu1Q9R0Q9 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mpdu1Q9R0Q9 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mpdu1Q9R0Q9 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mpdu1Q9R0Q9 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mpdu1Q9R0Q9 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Mpdu1Q9R0Q9 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mpdu1Q9R0Q9 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mpdu1Q9R0Q9 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms