Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0N8

Syt6, Synaptotagmin-6, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syt6Q9R0N8 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Syt6Q9R0N8 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Syt6Q9R0N8 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Syt6Q9R0N8 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Syt6Q9R0N8 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Syt6Q9R0N8 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Syt6Q9R0N8 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Syt6Q9R0N8 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Syt6Q9R0N8 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Syt6Q9R0N8 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Syt6Q9R0N8 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Syt6Q9R0N8 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Syt6Q9R0N8 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Syt6Q9R0N8 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Syt6Q9R0N8 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Syt6Q9R0N8 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Syt6Q9R0N8 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Syt6Q9R0N8 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Syt6Q9R0N8 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Syt6Q9R0N8 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Syt6Q9R0N8 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Syt6Q9R0N8 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Syt6Q9R0N8 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Syt6Q9R0N8 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Syt6Q9R0N8 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Syt6Q9R0N8 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Syt6Q9R0N8 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Syt6Q9R0N8 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Syt6Q9R0N8 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Syt6Q9R0N8 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Syt6Q9R0N8 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Syt6Q9R0N8 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Syt6Q9R0N8 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syt6Q9R0N8 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syt6Q9R0N8 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syt6Q9R0N8 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syt6Q9R0N8 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syt6Q9R0N8 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syt6Q9R0N8 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syt6Q9R0N8 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syt6Q9R0N8 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syt6Q9R0N8 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syt6Q9R0N8 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syt6Q9R0N8 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syt6Q9R0N8 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syt6Q9R0N8 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syt6Q9R0N8 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Syt6Q9R0N8 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syt6Q9R0N8 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syt6Q9R0N8 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syt6Q9R0N8 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syt6Q9R0N8 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syt6Q9R0N8 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syt6Q9R0N8 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syt6Q9R0N8 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syt6Q9R0N8 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Syt6Q9R0N8 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syt6Q9R0N8 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syt6Q9R0N8 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syt6Q9R0N8 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syt6Q9R0N8 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Syt6Q9R0N8 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syt6Q9R0N8 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syt6Q9R0N8 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syt6Q9R0N8 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syt6Q9R0N8 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syt6Q9R0N8 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syt6Q9R0N8 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syt6Q9R0N8 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syt6Q9R0N8 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syt6Q9R0N8 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syt6Q9R0N8 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syt6Q9R0N8 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syt6Q9R0N8 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syt6Q9R0N8 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syt6Q9R0N8 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syt6Q9R0N8 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syt6Q9R0N8 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syt6Q9R0N8 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syt6Q9R0N8 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syt6Q9R0N8 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syt6Q9R0N8 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syt6Q9R0N8 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syt6Q9R0N8 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syt6Q9R0N8 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syt6Q9R0N8 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syt6Q9R0N8 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syt6Q9R0N8 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syt6Q9R0N8 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syt6Q9R0N8 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syt6Q9R0N8 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syt6Q9R0N8 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Syt6Q9R0N8 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syt6Q9R0N8 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syt6Q9R0N8 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syt6Q9R0N8 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syt6Q9R0N8 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syt6Q9R0N8 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syt6Q9R0N8 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syt6Q9R0N8 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms