Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0L1

Hsf4, Heat shock factor protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hsf4Q9R0L1 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hsf4Q9R0L1 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hsf4Q9R0L1 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hsf4Q9R0L1 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hsf4Q9R0L1 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hsf4Q9R0L1 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hsf4Q9R0L1 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hsf4Q9R0L1 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hsf4Q9R0L1 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hsf4Q9R0L1 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hsf4Q9R0L1 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hsf4Q9R0L1 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hsf4Q9R0L1 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hsf4Q9R0L1 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hsf4Q9R0L1 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hsf4Q9R0L1 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hsf4Q9R0L1 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hsf4Q9R0L1 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hsf4Q9R0L1 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hsf4Q9R0L1 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hsf4Q9R0L1 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hsf4Q9R0L1 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hsf4Q9R0L1 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hsf4Q9R0L1 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hsf4Q9R0L1 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hsf4Q9R0L1 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hsf4Q9R0L1 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hsf4Q9R0L1 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hsf4Q9R0L1 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hsf4Q9R0L1 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hsf4Q9R0L1 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Hsf4Q9R0L1 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Hsf4Q9R0L1 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hsf4Q9R0L1 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hsf4Q9R0L1 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hsf4Q9R0L1 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hsf4Q9R0L1 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hsf4Q9R0L1 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hsf4Q9R0L1 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hsf4Q9R0L1 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hsf4Q9R0L1 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hsf4Q9R0L1 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Hsf4Q9R0L1 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hsf4Q9R0L1 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hsf4Q9R0L1 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Hsf4Q9R0L1 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hsf4Q9R0L1 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hsf4Q9R0L1 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hsf4Q9R0L1 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hsf4Q9R0L1 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hsf4Q9R0L1 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hsf4Q9R0L1 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hsf4Q9R0L1 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hsf4Q9R0L1 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hsf4Q9R0L1 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hsf4Q9R0L1 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hsf4Q9R0L1 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hsf4Q9R0L1 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hsf4Q9R0L1 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Hsf4Q9R0L1 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hsf4Q9R0L1 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hsf4Q9R0L1 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hsf4Q9R0L1 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hsf4Q9R0L1 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hsf4Q9R0L1 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hsf4Q9R0L1 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hsf4Q9R0L1 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hsf4Q9R0L1 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hsf4Q9R0L1 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hsf4Q9R0L1 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hsf4Q9R0L1 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hsf4Q9R0L1 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hsf4Q9R0L1 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hsf4Q9R0L1 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hsf4Q9R0L1 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Hsf4Q9R0L1 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Hsf4Q9R0L1 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hsf4Q9R0L1 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hsf4Q9R0L1 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hsf4Q9R0L1 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hsf4Q9R0L1 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hsf4Q9R0L1 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hsf4Q9R0L1 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hsf4Q9R0L1 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hsf4Q9R0L1 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hsf4Q9R0L1 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hsf4Q9R0L1 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hsf4Q9R0L1 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hsf4Q9R0L1 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hsf4Q9R0L1 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hsf4Q9R0L1 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hsf4Q9R0L1 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hsf4Q9R0L1 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hsf4Q9R0L1 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hsf4Q9R0L1 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hsf4Q9R0L1 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hsf4Q9R0L1 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hsf4Q9R0L1 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hsf4Q9R0L1 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hsf4Q9R0L1 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms