Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0K7

Atp2b2, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b2Q9R0K7 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Atp2b2Q9R0K7 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Atp2b2Q9R0K7 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Atp2b2Q9R0K7 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Atp2b2Q9R0K7 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Atp2b2Q9R0K7 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Atp2b2Q9R0K7 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Atp2b2Q9R0K7 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Atp2b2Q9R0K7 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Atp2b2Q9R0K7 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Atp2b2Q9R0K7 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Atp2b2Q9R0K7 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Atp2b2Q9R0K7 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Atp2b2Q9R0K7 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Atp2b2Q9R0K7 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Atp2b2Q9R0K7 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Atp2b2Q9R0K7 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Atp2b2Q9R0K7 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Atp2b2Q9R0K7 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Atp2b2Q9R0K7 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Atp2b2Q9R0K7 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Atp2b2Q9R0K7 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Atp2b2Q9R0K7 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Atp2b2Q9R0K7 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Atp2b2Q9R0K7 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Atp2b2Q9R0K7 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Atp2b2Q9R0K7 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Atp2b2Q9R0K7 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Atp2b2Q9R0K7 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Atp2b2Q9R0K7 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Atp2b2Q9R0K7 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Atp2b2Q9R0K7 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Atp2b2Q9R0K7 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Atp2b2Q9R0K7 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Atp2b2Q9R0K7 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Atp2b2Q9R0K7 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Atp2b2Q9R0K7 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Atp2b2Q9R0K7 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Atp2b2Q9R0K7 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Atp2b2Q9R0K7 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Atp2b2Q9R0K7 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Atp2b2Q9R0K7 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Atp2b2Q9R0K7 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Atp2b2Q9R0K7 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Atp2b2Q9R0K7 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Atp2b2Q9R0K7 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Atp2b2Q9R0K7 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Atp2b2Q9R0K7 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Atp2b2Q9R0K7 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Atp2b2Q9R0K7 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Atp2b2Q9R0K7 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Atp2b2Q9R0K7 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Atp2b2Q9R0K7 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Atp2b2Q9R0K7 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Atp2b2Q9R0K7 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Atp2b2Q9R0K7 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Atp2b2Q9R0K7 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Atp2b2Q9R0K7 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Atp2b2Q9R0K7 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Atp2b2Q9R0K7 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Atp2b2Q9R0K7 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Atp2b2Q9R0K7 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Atp2b2Q9R0K7 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Atp2b2Q9R0K7 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Atp2b2Q9R0K7 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Atp2b2Q9R0K7 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Atp2b2Q9R0K7 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Atp2b2Q9R0K7 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Atp2b2Q9R0K7 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Atp2b2Q9R0K7 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Atp2b2Q9R0K7 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Atp2b2Q9R0K7 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Atp2b2Q9R0K7 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
Atp2b2Q9R0K7 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Atp2b2Q9R0K7 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Atp2b2Q9R0K7 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Atp2b2Q9R0K7 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Atp2b2Q9R0K7 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Atp2b2Q9R0K7 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Atp2b2Q9R0K7 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Atp2b2Q9R0K7 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Atp2b2Q9R0K7 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Atp2b2Q9R0K7 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Atp2b2Q9R0K7 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Atp2b2Q9R0K7 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Atp2b2Q9R0K7 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Atp2b2Q9R0K7 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Atp2b2Q9R0K7 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Atp2b2Q9R0K7 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Atp2b2Q9R0K7 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Atp2b2Q9R0K7 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Atp2b2Q9R0K7 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Atp2b2Q9R0K7 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Atp2b2Q9R0K7 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Atp2b2Q9R0K7 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Atp2b2Q9R0K7 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Atp2b2Q9R0K7 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Atp2b2Q9R0K7 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Atp2b2Q9R0K7 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Atp2b2Q9R0K7 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms