Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0G7

Zeb2, Zinc finger E-box-binding homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zeb2Q9R0G7 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Zeb2Q9R0G7 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Zeb2Q9R0G7 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Zeb2Q9R0G7 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Zeb2Q9R0G7 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Zeb2Q9R0G7 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Zeb2Q9R0G7 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Zeb2Q9R0G7 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Zeb2Q9R0G7 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Zeb2Q9R0G7 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Zeb2Q9R0G7 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Zeb2Q9R0G7 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Zeb2Q9R0G7 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Zeb2Q9R0G7 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Zeb2Q9R0G7 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Zeb2Q9R0G7 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Zeb2Q9R0G7 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Zeb2Q9R0G7 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Zeb2Q9R0G7 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Zeb2Q9R0G7 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Zeb2Q9R0G7 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Zeb2Q9R0G7 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Zeb2Q9R0G7 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Zeb2Q9R0G7 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Zeb2Q9R0G7 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Zeb2Q9R0G7 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Zeb2Q9R0G7 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Zeb2Q9R0G7 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Zeb2Q9R0G7 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Zeb2Q9R0G7 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Zeb2Q9R0G7 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Zeb2Q9R0G7 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Zeb2Q9R0G7 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Zeb2Q9R0G7 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Zeb2Q9R0G7 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Zeb2Q9R0G7 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Zeb2Q9R0G7 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Zeb2Q9R0G7 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Zeb2Q9R0G7 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Zeb2Q9R0G7 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Zeb2Q9R0G7 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Zeb2Q9R0G7 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Zeb2Q9R0G7 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Zeb2Q9R0G7 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Zeb2Q9R0G7 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Zeb2Q9R0G7 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Zeb2Q9R0G7 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Zeb2Q9R0G7 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Zeb2Q9R0G7 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Zeb2Q9R0G7 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Zeb2Q9R0G7 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Zeb2Q9R0G7 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Zeb2Q9R0G7 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Zeb2Q9R0G7 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Zeb2Q9R0G7 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Zeb2Q9R0G7 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Zeb2Q9R0G7 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Zeb2Q9R0G7 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Zeb2Q9R0G7 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Zeb2Q9R0G7 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Zeb2Q9R0G7 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Zeb2Q9R0G7 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Zeb2Q9R0G7 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Zeb2Q9R0G7 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Zeb2Q9R0G7 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Zeb2Q9R0G7 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Zeb2Q9R0G7 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Zeb2Q9R0G7 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Zeb2Q9R0G7 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Zeb2Q9R0G7 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Zeb2Q9R0G7 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Zeb2Q9R0G7 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Zeb2Q9R0G7 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Zeb2Q9R0G7 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Zeb2Q9R0G7 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Zeb2Q9R0G7 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Zeb2Q9R0G7 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Zeb2Q9R0G7 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Zeb2Q9R0G7 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Zeb2Q9R0G7 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Zeb2Q9R0G7 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Zeb2Q9R0G7 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Zeb2Q9R0G7 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Zeb2Q9R0G7 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Zeb2Q9R0G7 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Zeb2Q9R0G7 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Zeb2Q9R0G7 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Zeb2Q9R0G7 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Zeb2Q9R0G7 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Zeb2Q9R0G7 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
Zeb2Q9R0G7 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Zeb2Q9R0G7 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Zeb2Q9R0G7 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Zeb2Q9R0G7 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Zeb2Q9R0G7 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Zeb2Q9R0G7 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Zeb2Q9R0G7 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Zeb2Q9R0G7 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Zeb2Q9R0G7 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Zeb2Q9R0G7 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms