Protein–RNA interactions for Protein: Q9R069

Bcam, Basal cell adhesion molecule, mousemouse

Predictions only

Length 622 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BcamQ9R069 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
BcamQ9R069 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
BcamQ9R069 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
BcamQ9R069 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BcamQ9R069 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC21.3■■□□□ 1
BcamQ9R069 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BcamQ9R069 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BcamQ9R069 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BcamQ9R069 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC21.3■■□□□ 1
BcamQ9R069 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BcamQ9R069 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
BcamQ9R069 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BcamQ9R069 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BcamQ9R069 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BcamQ9R069 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BcamQ9R069 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BcamQ9R069 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
BcamQ9R069 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
BcamQ9R069 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BcamQ9R069 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BcamQ9R069 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
BcamQ9R069 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BcamQ9R069 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BcamQ9R069 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BcamQ9R069 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BcamQ9R069 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
BcamQ9R069 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
BcamQ9R069 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BcamQ9R069 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BcamQ9R069 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BcamQ9R069 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
BcamQ9R069 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BcamQ9R069 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BcamQ9R069 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BcamQ9R069 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BcamQ9R069 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BcamQ9R069 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BcamQ9R069 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BcamQ9R069 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BcamQ9R069 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BcamQ9R069 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BcamQ9R069 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BcamQ9R069 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BcamQ9R069 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
BcamQ9R069 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BcamQ9R069 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BcamQ9R069 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BcamQ9R069 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
BcamQ9R069 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BcamQ9R069 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BcamQ9R069 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BcamQ9R069 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BcamQ9R069 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BcamQ9R069 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BcamQ9R069 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BcamQ9R069 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BcamQ9R069 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BcamQ9R069 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BcamQ9R069 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BcamQ9R069 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BcamQ9R069 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BcamQ9R069 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BcamQ9R069 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BcamQ9R069 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BcamQ9R069 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BcamQ9R069 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BcamQ9R069 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BcamQ9R069 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BcamQ9R069 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BcamQ9R069 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BcamQ9R069 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BcamQ9R069 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BcamQ9R069 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
BcamQ9R069 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BcamQ9R069 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BcamQ9R069 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BcamQ9R069 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BcamQ9R069 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BcamQ9R069 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BcamQ9R069 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BcamQ9R069 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BcamQ9R069 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BcamQ9R069 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BcamQ9R069 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BcamQ9R069 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BcamQ9R069 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BcamQ9R069 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
BcamQ9R069 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BcamQ9R069 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BcamQ9R069 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BcamQ9R069 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BcamQ9R069 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BcamQ9R069 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BcamQ9R069 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BcamQ9R069 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BcamQ9R069 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BcamQ9R069 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BcamQ9R069 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
BcamQ9R069 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
BcamQ9R069 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms