Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZM4

Tnfrsf10b, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 10B, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf10bQ9QZM4 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tnfrsf10bQ9QZM4 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tnfrsf10bQ9QZM4 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tnfrsf10bQ9QZM4 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tnfrsf10bQ9QZM4 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tnfrsf10bQ9QZM4 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tnfrsf10bQ9QZM4 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tnfrsf10bQ9QZM4 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tnfrsf10bQ9QZM4 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tnfrsf10bQ9QZM4 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tnfrsf10bQ9QZM4 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tnfrsf10bQ9QZM4 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tnfrsf10bQ9QZM4 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Tnfrsf10bQ9QZM4 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tnfrsf10bQ9QZM4 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tnfrsf10bQ9QZM4 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tnfrsf10bQ9QZM4 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tnfrsf10bQ9QZM4 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tnfrsf10bQ9QZM4 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tnfrsf10bQ9QZM4 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tnfrsf10bQ9QZM4 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tnfrsf10bQ9QZM4 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tnfrsf10bQ9QZM4 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tnfrsf10bQ9QZM4 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tnfrsf10bQ9QZM4 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tnfrsf10bQ9QZM4 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tnfrsf10bQ9QZM4 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tnfrsf10bQ9QZM4 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tnfrsf10bQ9QZM4 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tnfrsf10bQ9QZM4 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tnfrsf10bQ9QZM4 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tnfrsf10bQ9QZM4 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tnfrsf10bQ9QZM4 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tnfrsf10bQ9QZM4 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tnfrsf10bQ9QZM4 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tnfrsf10bQ9QZM4 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tnfrsf10bQ9QZM4 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tnfrsf10bQ9QZM4 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tnfrsf10bQ9QZM4 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms