Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZB6

Nr4a3, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 3, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr4a3Q9QZB6 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nr4a3Q9QZB6 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nr4a3Q9QZB6 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nr4a3Q9QZB6 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nr4a3Q9QZB6 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nr4a3Q9QZB6 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nr4a3Q9QZB6 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nr4a3Q9QZB6 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nr4a3Q9QZB6 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nr4a3Q9QZB6 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Nr4a3Q9QZB6 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nr4a3Q9QZB6 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nr4a3Q9QZB6 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nr4a3Q9QZB6 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nr4a3Q9QZB6 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Nr4a3Q9QZB6 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nr4a3Q9QZB6 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nr4a3Q9QZB6 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nr4a3Q9QZB6 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nr4a3Q9QZB6 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nr4a3Q9QZB6 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nr4a3Q9QZB6 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nr4a3Q9QZB6 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nr4a3Q9QZB6 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nr4a3Q9QZB6 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nr4a3Q9QZB6 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nr4a3Q9QZB6 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nr4a3Q9QZB6 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Nr4a3Q9QZB6 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nr4a3Q9QZB6 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nr4a3Q9QZB6 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nr4a3Q9QZB6 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nr4a3Q9QZB6 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nr4a3Q9QZB6 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nr4a3Q9QZB6 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nr4a3Q9QZB6 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nr4a3Q9QZB6 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nr4a3Q9QZB6 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nr4a3Q9QZB6 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nr4a3Q9QZB6 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nr4a3Q9QZB6 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nr4a3Q9QZB6 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nr4a3Q9QZB6 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nr4a3Q9QZB6 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nr4a3Q9QZB6 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nr4a3Q9QZB6 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nr4a3Q9QZB6 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nr4a3Q9QZB6 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nr4a3Q9QZB6 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nr4a3Q9QZB6 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nr4a3Q9QZB6 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nr4a3Q9QZB6 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nr4a3Q9QZB6 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nr4a3Q9QZB6 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nr4a3Q9QZB6 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nr4a3Q9QZB6 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nr4a3Q9QZB6 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nr4a3Q9QZB6 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nr4a3Q9QZB6 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Nr4a3Q9QZB6 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nr4a3Q9QZB6 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nr4a3Q9QZB6 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nr4a3Q9QZB6 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nr4a3Q9QZB6 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nr4a3Q9QZB6 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nr4a3Q9QZB6 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nr4a3Q9QZB6 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nr4a3Q9QZB6 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nr4a3Q9QZB6 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nr4a3Q9QZB6 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nr4a3Q9QZB6 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nr4a3Q9QZB6 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Nr4a3Q9QZB6 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Nr4a3Q9QZB6 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nr4a3Q9QZB6 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nr4a3Q9QZB6 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nr4a3Q9QZB6 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nr4a3Q9QZB6 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nr4a3Q9QZB6 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nr4a3Q9QZB6 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nr4a3Q9QZB6 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Nr4a3Q9QZB6 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nr4a3Q9QZB6 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nr4a3Q9QZB6 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nr4a3Q9QZB6 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nr4a3Q9QZB6 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nr4a3Q9QZB6 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nr4a3Q9QZB6 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nr4a3Q9QZB6 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Nr4a3Q9QZB6 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nr4a3Q9QZB6 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Nr4a3Q9QZB6 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nr4a3Q9QZB6 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nr4a3Q9QZB6 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nr4a3Q9QZB6 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nr4a3Q9QZB6 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nr4a3Q9QZB6 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nr4a3Q9QZB6 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nr4a3Q9QZB6 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nr4a3Q9QZB6 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms