Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ49

Ubxn8, UBX domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn8Q9QZ49 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Ubxn8Q9QZ49 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ubxn8Q9QZ49 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ubxn8Q9QZ49 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ubxn8Q9QZ49 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ubxn8Q9QZ49 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ubxn8Q9QZ49 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Ubxn8Q9QZ49 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ubxn8Q9QZ49 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ubxn8Q9QZ49 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ubxn8Q9QZ49 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Ubxn8Q9QZ49 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ubxn8Q9QZ49 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ubxn8Q9QZ49 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ubxn8Q9QZ49 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ubxn8Q9QZ49 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ubxn8Q9QZ49 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ubxn8Q9QZ49 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ubxn8Q9QZ49 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ubxn8Q9QZ49 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ubxn8Q9QZ49 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ubxn8Q9QZ49 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ubxn8Q9QZ49 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ubxn8Q9QZ49 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ubxn8Q9QZ49 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ubxn8Q9QZ49 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ubxn8Q9QZ49 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ubxn8Q9QZ49 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ubxn8Q9QZ49 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ubxn8Q9QZ49 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Ubxn8Q9QZ49 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Ubxn8Q9QZ49 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ubxn8Q9QZ49 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ubxn8Q9QZ49 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ubxn8Q9QZ49 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Ubxn8Q9QZ49 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ubxn8Q9QZ49 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ubxn8Q9QZ49 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ubxn8Q9QZ49 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ubxn8Q9QZ49 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ubxn8Q9QZ49 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ubxn8Q9QZ49 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ubxn8Q9QZ49 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ubxn8Q9QZ49 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ubxn8Q9QZ49 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ubxn8Q9QZ49 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ubxn8Q9QZ49 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ubxn8Q9QZ49 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ubxn8Q9QZ49 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ubxn8Q9QZ49 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ubxn8Q9QZ49 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ubxn8Q9QZ49 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ubxn8Q9QZ49 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ubxn8Q9QZ49 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ubxn8Q9QZ49 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ubxn8Q9QZ49 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ubxn8Q9QZ49 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ubxn8Q9QZ49 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ubxn8Q9QZ49 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Ubxn8Q9QZ49 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ubxn8Q9QZ49 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ubxn8Q9QZ49 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ubxn8Q9QZ49 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ubxn8Q9QZ49 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ubxn8Q9QZ49 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ubxn8Q9QZ49 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ubxn8Q9QZ49 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ubxn8Q9QZ49 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ubxn8Q9QZ49 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ubxn8Q9QZ49 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ubxn8Q9QZ49 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ubxn8Q9QZ49 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ubxn8Q9QZ49 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ubxn8Q9QZ49 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ubxn8Q9QZ49 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ubxn8Q9QZ49 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ubxn8Q9QZ49 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Ubxn8Q9QZ49 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ubxn8Q9QZ49 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ubxn8Q9QZ49 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ubxn8Q9QZ49 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ubxn8Q9QZ49 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ubxn8Q9QZ49 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ubxn8Q9QZ49 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ubxn8Q9QZ49 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ubxn8Q9QZ49 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ubxn8Q9QZ49 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ubxn8Q9QZ49 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ubxn8Q9QZ49 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ubxn8Q9QZ49 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ubxn8Q9QZ49 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ubxn8Q9QZ49 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ubxn8Q9QZ49 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ubxn8Q9QZ49 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ubxn8Q9QZ49 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ubxn8Q9QZ49 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ubxn8Q9QZ49 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ubxn8Q9QZ49 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ubxn8Q9QZ49 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ubxn8Q9QZ49 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms