Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ09

Phtf1, Putative homeodomain transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phtf1Q9QZ09 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Phtf1Q9QZ09 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Phtf1Q9QZ09 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Phtf1Q9QZ09 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Phtf1Q9QZ09 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Phtf1Q9QZ09 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Phtf1Q9QZ09 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Phtf1Q9QZ09 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Phtf1Q9QZ09 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Phtf1Q9QZ09 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Phtf1Q9QZ09 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Phtf1Q9QZ09 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Phtf1Q9QZ09 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Phtf1Q9QZ09 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Phtf1Q9QZ09 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Phtf1Q9QZ09 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Phtf1Q9QZ09 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Phtf1Q9QZ09 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Phtf1Q9QZ09 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Phtf1Q9QZ09 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Phtf1Q9QZ09 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Phtf1Q9QZ09 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Phtf1Q9QZ09 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Phtf1Q9QZ09 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Phtf1Q9QZ09 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Phtf1Q9QZ09 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Phtf1Q9QZ09 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Phtf1Q9QZ09 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Phtf1Q9QZ09 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Phtf1Q9QZ09 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Phtf1Q9QZ09 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Phtf1Q9QZ09 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Phtf1Q9QZ09 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Phtf1Q9QZ09 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Phtf1Q9QZ09 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Phtf1Q9QZ09 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Phtf1Q9QZ09 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Phtf1Q9QZ09 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Phtf1Q9QZ09 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Phtf1Q9QZ09 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Phtf1Q9QZ09 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Phtf1Q9QZ09 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Phtf1Q9QZ09 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Phtf1Q9QZ09 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Phtf1Q9QZ09 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Phtf1Q9QZ09 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Phtf1Q9QZ09 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Phtf1Q9QZ09 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Phtf1Q9QZ09 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Phtf1Q9QZ09 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Phtf1Q9QZ09 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Phtf1Q9QZ09 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Phtf1Q9QZ09 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Phtf1Q9QZ09 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Phtf1Q9QZ09 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Phtf1Q9QZ09 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Phtf1Q9QZ09 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Phtf1Q9QZ09 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Phtf1Q9QZ09 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Phtf1Q9QZ09 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Phtf1Q9QZ09 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Phtf1Q9QZ09 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Phtf1Q9QZ09 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Phtf1Q9QZ09 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Phtf1Q9QZ09 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Phtf1Q9QZ09 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Phtf1Q9QZ09 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Phtf1Q9QZ09 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Phtf1Q9QZ09 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Phtf1Q9QZ09 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Phtf1Q9QZ09 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Phtf1Q9QZ09 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Phtf1Q9QZ09 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Phtf1Q9QZ09 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Phtf1Q9QZ09 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Phtf1Q9QZ09 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Phtf1Q9QZ09 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Phtf1Q9QZ09 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Phtf1Q9QZ09 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Phtf1Q9QZ09 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Phtf1Q9QZ09 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Phtf1Q9QZ09 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Phtf1Q9QZ09 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Phtf1Q9QZ09 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Phtf1Q9QZ09 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Phtf1Q9QZ09 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Phtf1Q9QZ09 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Phtf1Q9QZ09 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Phtf1Q9QZ09 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Phtf1Q9QZ09 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Phtf1Q9QZ09 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Phtf1Q9QZ09 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Phtf1Q9QZ09 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Phtf1Q9QZ09 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Phtf1Q9QZ09 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Phtf1Q9QZ09 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Phtf1Q9QZ09 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Phtf1Q9QZ09 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Phtf1Q9QZ09 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Phtf1Q9QZ09 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms