Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYR7

Acot3, Acyl-coenzyme A thioesterase 3, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acot3Q9QYR7 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Acot3Q9QYR7 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Acot3Q9QYR7 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Acot3Q9QYR7 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Acot3Q9QYR7 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Acot3Q9QYR7 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Acot3Q9QYR7 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Acot3Q9QYR7 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Acot3Q9QYR7 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Acot3Q9QYR7 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Acot3Q9QYR7 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Acot3Q9QYR7 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Acot3Q9QYR7 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Acot3Q9QYR7 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Acot3Q9QYR7 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Acot3Q9QYR7 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Acot3Q9QYR7 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Acot3Q9QYR7 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Acot3Q9QYR7 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Acot3Q9QYR7 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Acot3Q9QYR7 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Acot3Q9QYR7 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Acot3Q9QYR7 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Acot3Q9QYR7 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Acot3Q9QYR7 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Acot3Q9QYR7 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Acot3Q9QYR7 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Acot3Q9QYR7 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Acot3Q9QYR7 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Acot3Q9QYR7 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Acot3Q9QYR7 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Acot3Q9QYR7 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Acot3Q9QYR7 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Acot3Q9QYR7 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Acot3Q9QYR7 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Acot3Q9QYR7 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Acot3Q9QYR7 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Acot3Q9QYR7 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Acot3Q9QYR7 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Acot3Q9QYR7 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Acot3Q9QYR7 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Acot3Q9QYR7 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Acot3Q9QYR7 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Acot3Q9QYR7 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Acot3Q9QYR7 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Acot3Q9QYR7 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Acot3Q9QYR7 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Acot3Q9QYR7 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Acot3Q9QYR7 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Acot3Q9QYR7 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Acot3Q9QYR7 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Acot3Q9QYR7 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Acot3Q9QYR7 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Acot3Q9QYR7 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Acot3Q9QYR7 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Acot3Q9QYR7 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Acot3Q9QYR7 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Acot3Q9QYR7 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Acot3Q9QYR7 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Acot3Q9QYR7 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Acot3Q9QYR7 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Acot3Q9QYR7 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Acot3Q9QYR7 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Acot3Q9QYR7 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Acot3Q9QYR7 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Acot3Q9QYR7 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Acot3Q9QYR7 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Acot3Q9QYR7 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Acot3Q9QYR7 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Acot3Q9QYR7 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Acot3Q9QYR7 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Acot3Q9QYR7 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Acot3Q9QYR7 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Acot3Q9QYR7 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Acot3Q9QYR7 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Acot3Q9QYR7 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Acot3Q9QYR7 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Acot3Q9QYR7 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Acot3Q9QYR7 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Acot3Q9QYR7 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Acot3Q9QYR7 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Acot3Q9QYR7 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Acot3Q9QYR7 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Acot3Q9QYR7 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Acot3Q9QYR7 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Acot3Q9QYR7 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Acot3Q9QYR7 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Acot3Q9QYR7 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Acot3Q9QYR7 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Acot3Q9QYR7 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Acot3Q9QYR7 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Acot3Q9QYR7 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Acot3Q9QYR7 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Acot3Q9QYR7 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Acot3Q9QYR7 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Acot3Q9QYR7 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Acot3Q9QYR7 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Acot3Q9QYR7 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Acot3Q9QYR7 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Acot3Q9QYR7 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms