Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYR6

Map1a, Microtubule-associated protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 2,776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Map1aQ9QYR6 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Map1aQ9QYR6 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Map1aQ9QYR6 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Map1aQ9QYR6 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Map1aQ9QYR6 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Map1aQ9QYR6 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Map1aQ9QYR6 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Map1aQ9QYR6 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Map1aQ9QYR6 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Map1aQ9QYR6 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Map1aQ9QYR6 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Map1aQ9QYR6 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Map1aQ9QYR6 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Map1aQ9QYR6 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Map1aQ9QYR6 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Map1aQ9QYR6 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Map1aQ9QYR6 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Map1aQ9QYR6 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Map1aQ9QYR6 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Map1aQ9QYR6 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Map1aQ9QYR6 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Map1aQ9QYR6 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Map1aQ9QYR6 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Map1aQ9QYR6 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Map1aQ9QYR6 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Map1aQ9QYR6 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Map1aQ9QYR6 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Map1aQ9QYR6 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Map1aQ9QYR6 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Map1aQ9QYR6 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Map1aQ9QYR6 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Map1aQ9QYR6 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Map1aQ9QYR6 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Map1aQ9QYR6 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Map1aQ9QYR6 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Map1aQ9QYR6 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Map1aQ9QYR6 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Map1aQ9QYR6 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Map1aQ9QYR6 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Map1aQ9QYR6 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Map1aQ9QYR6 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Map1aQ9QYR6 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Map1aQ9QYR6 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Map1aQ9QYR6 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Map1aQ9QYR6 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Map1aQ9QYR6 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Map1aQ9QYR6 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Map1aQ9QYR6 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Map1aQ9QYR6 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Map1aQ9QYR6 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Map1aQ9QYR6 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Map1aQ9QYR6 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Map1aQ9QYR6 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Map1aQ9QYR6 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Map1aQ9QYR6 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Map1aQ9QYR6 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Map1aQ9QYR6 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Map1aQ9QYR6 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Map1aQ9QYR6 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Map1aQ9QYR6 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Map1aQ9QYR6 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Map1aQ9QYR6 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Map1aQ9QYR6 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Map1aQ9QYR6 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Map1aQ9QYR6 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Map1aQ9QYR6 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Map1aQ9QYR6 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Map1aQ9QYR6 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Map1aQ9QYR6 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Map1aQ9QYR6 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Map1aQ9QYR6 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Map1aQ9QYR6 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Map1aQ9QYR6 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Map1aQ9QYR6 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Map1aQ9QYR6 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Map1aQ9QYR6 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Map1aQ9QYR6 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Map1aQ9QYR6 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Map1aQ9QYR6 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Map1aQ9QYR6 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Map1aQ9QYR6 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Map1aQ9QYR6 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Map1aQ9QYR6 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Map1aQ9QYR6 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Map1aQ9QYR6 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Map1aQ9QYR6 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Map1aQ9QYR6 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Map1aQ9QYR6 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Map1aQ9QYR6 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Map1aQ9QYR6 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Map1aQ9QYR6 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Map1aQ9QYR6 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Map1aQ9QYR6 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Map1aQ9QYR6 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Map1aQ9QYR6 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Map1aQ9QYR6 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Map1aQ9QYR6 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Map1aQ9QYR6 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Map1aQ9QYR6 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Map1aQ9QYR6 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms