Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYM9

Tmeff2, Tomoregulin-2, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmeff2Q9QYM9 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmeff2Q9QYM9 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmeff2Q9QYM9 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmeff2Q9QYM9 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmeff2Q9QYM9 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmeff2Q9QYM9 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmeff2Q9QYM9 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmeff2Q9QYM9 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmeff2Q9QYM9 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmeff2Q9QYM9 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmeff2Q9QYM9 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tmeff2Q9QYM9 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tmeff2Q9QYM9 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Tmeff2Q9QYM9 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tmeff2Q9QYM9 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Tmeff2Q9QYM9 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tmeff2Q9QYM9 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tmeff2Q9QYM9 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tmeff2Q9QYM9 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tmeff2Q9QYM9 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tmeff2Q9QYM9 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tmeff2Q9QYM9 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tmeff2Q9QYM9 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmeff2Q9QYM9 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmeff2Q9QYM9 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmeff2Q9QYM9 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmeff2Q9QYM9 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmeff2Q9QYM9 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmeff2Q9QYM9 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmeff2Q9QYM9 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmeff2Q9QYM9 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmeff2Q9QYM9 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmeff2Q9QYM9 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmeff2Q9QYM9 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmeff2Q9QYM9 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmeff2Q9QYM9 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmeff2Q9QYM9 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmeff2Q9QYM9 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmeff2Q9QYM9 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmeff2Q9QYM9 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmeff2Q9QYM9 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmeff2Q9QYM9 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmeff2Q9QYM9 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmeff2Q9QYM9 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmeff2Q9QYM9 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmeff2Q9QYM9 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmeff2Q9QYM9 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmeff2Q9QYM9 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmeff2Q9QYM9 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmeff2Q9QYM9 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmeff2Q9QYM9 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmeff2Q9QYM9 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmeff2Q9QYM9 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmeff2Q9QYM9 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmeff2Q9QYM9 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmeff2Q9QYM9 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmeff2Q9QYM9 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmeff2Q9QYM9 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmeff2Q9QYM9 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmeff2Q9QYM9 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmeff2Q9QYM9 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmeff2Q9QYM9 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmeff2Q9QYM9 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmeff2Q9QYM9 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmeff2Q9QYM9 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmeff2Q9QYM9 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmeff2Q9QYM9 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmeff2Q9QYM9 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmeff2Q9QYM9 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmeff2Q9QYM9 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmeff2Q9QYM9 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmeff2Q9QYM9 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmeff2Q9QYM9 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmeff2Q9QYM9 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmeff2Q9QYM9 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmeff2Q9QYM9 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmeff2Q9QYM9 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmeff2Q9QYM9 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmeff2Q9QYM9 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmeff2Q9QYM9 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmeff2Q9QYM9 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmeff2Q9QYM9 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmeff2Q9QYM9 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmeff2Q9QYM9 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmeff2Q9QYM9 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmeff2Q9QYM9 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmeff2Q9QYM9 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmeff2Q9QYM9 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmeff2Q9QYM9 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmeff2Q9QYM9 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmeff2Q9QYM9 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmeff2Q9QYM9 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmeff2Q9QYM9 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmeff2Q9QYM9 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tmeff2Q9QYM9 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tmeff2Q9QYM9 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tmeff2Q9QYM9 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tmeff2Q9QYM9 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tmeff2Q9QYM9 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tmeff2Q9QYM9 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms