Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYF1

Rdh11, Retinol dehydrogenase 11, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh11Q9QYF1 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rdh11Q9QYF1 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rdh11Q9QYF1 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rdh11Q9QYF1 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rdh11Q9QYF1 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rdh11Q9QYF1 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rdh11Q9QYF1 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rdh11Q9QYF1 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rdh11Q9QYF1 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rdh11Q9QYF1 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rdh11Q9QYF1 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rdh11Q9QYF1 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rdh11Q9QYF1 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rdh11Q9QYF1 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rdh11Q9QYF1 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rdh11Q9QYF1 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rdh11Q9QYF1 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rdh11Q9QYF1 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rdh11Q9QYF1 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rdh11Q9QYF1 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rdh11Q9QYF1 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rdh11Q9QYF1 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rdh11Q9QYF1 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rdh11Q9QYF1 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rdh11Q9QYF1 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rdh11Q9QYF1 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rdh11Q9QYF1 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rdh11Q9QYF1 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rdh11Q9QYF1 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rdh11Q9QYF1 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rdh11Q9QYF1 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rdh11Q9QYF1 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rdh11Q9QYF1 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rdh11Q9QYF1 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rdh11Q9QYF1 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rdh11Q9QYF1 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rdh11Q9QYF1 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rdh11Q9QYF1 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rdh11Q9QYF1 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rdh11Q9QYF1 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rdh11Q9QYF1 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rdh11Q9QYF1 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rdh11Q9QYF1 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rdh11Q9QYF1 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rdh11Q9QYF1 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rdh11Q9QYF1 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rdh11Q9QYF1 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rdh11Q9QYF1 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rdh11Q9QYF1 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rdh11Q9QYF1 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rdh11Q9QYF1 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rdh11Q9QYF1 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rdh11Q9QYF1 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rdh11Q9QYF1 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rdh11Q9QYF1 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rdh11Q9QYF1 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rdh11Q9QYF1 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rdh11Q9QYF1 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rdh11Q9QYF1 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rdh11Q9QYF1 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rdh11Q9QYF1 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rdh11Q9QYF1 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rdh11Q9QYF1 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rdh11Q9QYF1 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rdh11Q9QYF1 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rdh11Q9QYF1 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rdh11Q9QYF1 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rdh11Q9QYF1 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rdh11Q9QYF1 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rdh11Q9QYF1 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rdh11Q9QYF1 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rdh11Q9QYF1 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rdh11Q9QYF1 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rdh11Q9QYF1 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rdh11Q9QYF1 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rdh11Q9QYF1 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rdh11Q9QYF1 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rdh11Q9QYF1 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rdh11Q9QYF1 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Rdh11Q9QYF1 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rdh11Q9QYF1 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rdh11Q9QYF1 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rdh11Q9QYF1 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rdh11Q9QYF1 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rdh11Q9QYF1 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rdh11Q9QYF1 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Rdh11Q9QYF1 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rdh11Q9QYF1 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rdh11Q9QYF1 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rdh11Q9QYF1 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rdh11Q9QYF1 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rdh11Q9QYF1 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rdh11Q9QYF1 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rdh11Q9QYF1 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rdh11Q9QYF1 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rdh11Q9QYF1 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Rdh11Q9QYF1 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rdh11Q9QYF1 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rdh11Q9QYF1 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rdh11Q9QYF1 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms