Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY80

Hacd1, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 1, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hacd1Q9QY80 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Hacd1Q9QY80 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Hacd1Q9QY80 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hacd1Q9QY80 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hacd1Q9QY80 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hacd1Q9QY80 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hacd1Q9QY80 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Hacd1Q9QY80 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hacd1Q9QY80 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hacd1Q9QY80 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hacd1Q9QY80 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hacd1Q9QY80 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hacd1Q9QY80 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hacd1Q9QY80 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hacd1Q9QY80 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hacd1Q9QY80 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hacd1Q9QY80 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hacd1Q9QY80 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hacd1Q9QY80 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hacd1Q9QY80 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hacd1Q9QY80 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hacd1Q9QY80 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hacd1Q9QY80 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hacd1Q9QY80 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Hacd1Q9QY80 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hacd1Q9QY80 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hacd1Q9QY80 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hacd1Q9QY80 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hacd1Q9QY80 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hacd1Q9QY80 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hacd1Q9QY80 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hacd1Q9QY80 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hacd1Q9QY80 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hacd1Q9QY80 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hacd1Q9QY80 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hacd1Q9QY80 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hacd1Q9QY80 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hacd1Q9QY80 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hacd1Q9QY80 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hacd1Q9QY80 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hacd1Q9QY80 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hacd1Q9QY80 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hacd1Q9QY80 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hacd1Q9QY80 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hacd1Q9QY80 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hacd1Q9QY80 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hacd1Q9QY80 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Hacd1Q9QY80 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hacd1Q9QY80 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hacd1Q9QY80 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hacd1Q9QY80 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hacd1Q9QY80 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hacd1Q9QY80 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hacd1Q9QY80 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Hacd1Q9QY80 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hacd1Q9QY80 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hacd1Q9QY80 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hacd1Q9QY80 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hacd1Q9QY80 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hacd1Q9QY80 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hacd1Q9QY80 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hacd1Q9QY80 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hacd1Q9QY80 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hacd1Q9QY80 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hacd1Q9QY80 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hacd1Q9QY80 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hacd1Q9QY80 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hacd1Q9QY80 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hacd1Q9QY80 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hacd1Q9QY80 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hacd1Q9QY80 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hacd1Q9QY80 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hacd1Q9QY80 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hacd1Q9QY80 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hacd1Q9QY80 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hacd1Q9QY80 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hacd1Q9QY80 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hacd1Q9QY80 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hacd1Q9QY80 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hacd1Q9QY80 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hacd1Q9QY80 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hacd1Q9QY80 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hacd1Q9QY80 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Hacd1Q9QY80 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hacd1Q9QY80 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Hacd1Q9QY80 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Hacd1Q9QY80 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hacd1Q9QY80 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hacd1Q9QY80 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hacd1Q9QY80 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Hacd1Q9QY80 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hacd1Q9QY80 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hacd1Q9QY80 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hacd1Q9QY80 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hacd1Q9QY80 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hacd1Q9QY80 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Hacd1Q9QY80 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Hacd1Q9QY80 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Hacd1Q9QY80 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hacd1Q9QY80 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms