Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY23

Pkp3, Plakophilin-3, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp3Q9QY23 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Pkp3Q9QY23 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pkp3Q9QY23 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pkp3Q9QY23 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pkp3Q9QY23 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pkp3Q9QY23 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pkp3Q9QY23 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pkp3Q9QY23 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pkp3Q9QY23 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pkp3Q9QY23 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Pkp3Q9QY23 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pkp3Q9QY23 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pkp3Q9QY23 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pkp3Q9QY23 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pkp3Q9QY23 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pkp3Q9QY23 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pkp3Q9QY23 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pkp3Q9QY23 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pkp3Q9QY23 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pkp3Q9QY23 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Pkp3Q9QY23 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pkp3Q9QY23 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pkp3Q9QY23 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pkp3Q9QY23 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pkp3Q9QY23 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pkp3Q9QY23 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pkp3Q9QY23 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pkp3Q9QY23 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pkp3Q9QY23 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pkp3Q9QY23 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pkp3Q9QY23 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pkp3Q9QY23 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pkp3Q9QY23 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pkp3Q9QY23 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pkp3Q9QY23 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pkp3Q9QY23 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pkp3Q9QY23 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pkp3Q9QY23 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pkp3Q9QY23 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pkp3Q9QY23 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pkp3Q9QY23 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pkp3Q9QY23 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pkp3Q9QY23 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pkp3Q9QY23 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pkp3Q9QY23 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pkp3Q9QY23 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pkp3Q9QY23 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pkp3Q9QY23 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pkp3Q9QY23 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pkp3Q9QY23 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pkp3Q9QY23 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pkp3Q9QY23 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pkp3Q9QY23 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pkp3Q9QY23 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pkp3Q9QY23 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pkp3Q9QY23 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pkp3Q9QY23 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pkp3Q9QY23 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pkp3Q9QY23 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pkp3Q9QY23 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pkp3Q9QY23 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pkp3Q9QY23 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pkp3Q9QY23 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pkp3Q9QY23 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pkp3Q9QY23 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pkp3Q9QY23 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pkp3Q9QY23 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Pkp3Q9QY23 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pkp3Q9QY23 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pkp3Q9QY23 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pkp3Q9QY23 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pkp3Q9QY23 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pkp3Q9QY23 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pkp3Q9QY23 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Pkp3Q9QY23 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pkp3Q9QY23 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pkp3Q9QY23 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pkp3Q9QY23 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pkp3Q9QY23 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pkp3Q9QY23 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pkp3Q9QY23 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pkp3Q9QY23 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pkp3Q9QY23 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pkp3Q9QY23 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pkp3Q9QY23 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pkp3Q9QY23 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pkp3Q9QY23 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pkp3Q9QY23 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pkp3Q9QY23 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pkp3Q9QY23 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pkp3Q9QY23 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pkp3Q9QY23 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pkp3Q9QY23 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pkp3Q9QY23 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Pkp3Q9QY23 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pkp3Q9QY23 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pkp3Q9QY23 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pkp3Q9QY23 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pkp3Q9QY23 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Pkp3Q9QY23 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms