Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXX8

Nufip1, Nuclear fragile X mental retardation-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nufip1Q9QXX8 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nufip1Q9QXX8 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nufip1Q9QXX8 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nufip1Q9QXX8 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nufip1Q9QXX8 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nufip1Q9QXX8 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nufip1Q9QXX8 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nufip1Q9QXX8 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nufip1Q9QXX8 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nufip1Q9QXX8 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nufip1Q9QXX8 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nufip1Q9QXX8 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nufip1Q9QXX8 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nufip1Q9QXX8 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nufip1Q9QXX8 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nufip1Q9QXX8 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nufip1Q9QXX8 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nufip1Q9QXX8 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nufip1Q9QXX8 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nufip1Q9QXX8 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nufip1Q9QXX8 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nufip1Q9QXX8 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nufip1Q9QXX8 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Nufip1Q9QXX8 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nufip1Q9QXX8 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nufip1Q9QXX8 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Nufip1Q9QXX8 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nufip1Q9QXX8 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nufip1Q9QXX8 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nufip1Q9QXX8 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nufip1Q9QXX8 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Nufip1Q9QXX8 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nufip1Q9QXX8 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nufip1Q9QXX8 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nufip1Q9QXX8 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nufip1Q9QXX8 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nufip1Q9QXX8 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nufip1Q9QXX8 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nufip1Q9QXX8 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nufip1Q9QXX8 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nufip1Q9QXX8 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nufip1Q9QXX8 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nufip1Q9QXX8 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nufip1Q9QXX8 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nufip1Q9QXX8 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nufip1Q9QXX8 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nufip1Q9QXX8 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nufip1Q9QXX8 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Nufip1Q9QXX8 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nufip1Q9QXX8 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nufip1Q9QXX8 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Nufip1Q9QXX8 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nufip1Q9QXX8 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nufip1Q9QXX8 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nufip1Q9QXX8 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nufip1Q9QXX8 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nufip1Q9QXX8 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nufip1Q9QXX8 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Nufip1Q9QXX8 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nufip1Q9QXX8 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nufip1Q9QXX8 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nufip1Q9QXX8 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nufip1Q9QXX8 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nufip1Q9QXX8 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nufip1Q9QXX8 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nufip1Q9QXX8 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nufip1Q9QXX8 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Nufip1Q9QXX8 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nufip1Q9QXX8 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nufip1Q9QXX8 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Nufip1Q9QXX8 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nufip1Q9QXX8 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nufip1Q9QXX8 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nufip1Q9QXX8 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nufip1Q9QXX8 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nufip1Q9QXX8 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nufip1Q9QXX8 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nufip1Q9QXX8 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nufip1Q9QXX8 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nufip1Q9QXX8 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nufip1Q9QXX8 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nufip1Q9QXX8 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nufip1Q9QXX8 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nufip1Q9QXX8 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nufip1Q9QXX8 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nufip1Q9QXX8 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nufip1Q9QXX8 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nufip1Q9QXX8 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nufip1Q9QXX8 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nufip1Q9QXX8 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nufip1Q9QXX8 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Nufip1Q9QXX8 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nufip1Q9QXX8 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nufip1Q9QXX8 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nufip1Q9QXX8 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nufip1Q9QXX8 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nufip1Q9QXX8 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Nufip1Q9QXX8 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nufip1Q9QXX8 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nufip1Q9QXX8 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms