Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXV1

Cbx8, Chromobox protein homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx8Q9QXV1 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cbx8Q9QXV1 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cbx8Q9QXV1 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cbx8Q9QXV1 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cbx8Q9QXV1 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cbx8Q9QXV1 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cbx8Q9QXV1 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cbx8Q9QXV1 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Cbx8Q9QXV1 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cbx8Q9QXV1 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cbx8Q9QXV1 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cbx8Q9QXV1 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cbx8Q9QXV1 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cbx8Q9QXV1 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cbx8Q9QXV1 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cbx8Q9QXV1 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cbx8Q9QXV1 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cbx8Q9QXV1 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cbx8Q9QXV1 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cbx8Q9QXV1 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cbx8Q9QXV1 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cbx8Q9QXV1 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cbx8Q9QXV1 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cbx8Q9QXV1 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cbx8Q9QXV1 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cbx8Q9QXV1 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Cbx8Q9QXV1 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cbx8Q9QXV1 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cbx8Q9QXV1 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cbx8Q9QXV1 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cbx8Q9QXV1 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cbx8Q9QXV1 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cbx8Q9QXV1 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cbx8Q9QXV1 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cbx8Q9QXV1 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cbx8Q9QXV1 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cbx8Q9QXV1 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Cbx8Q9QXV1 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cbx8Q9QXV1 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cbx8Q9QXV1 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cbx8Q9QXV1 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cbx8Q9QXV1 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cbx8Q9QXV1 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cbx8Q9QXV1 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cbx8Q9QXV1 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cbx8Q9QXV1 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cbx8Q9QXV1 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cbx8Q9QXV1 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cbx8Q9QXV1 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cbx8Q9QXV1 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cbx8Q9QXV1 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cbx8Q9QXV1 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cbx8Q9QXV1 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cbx8Q9QXV1 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cbx8Q9QXV1 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cbx8Q9QXV1 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cbx8Q9QXV1 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cbx8Q9QXV1 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cbx8Q9QXV1 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cbx8Q9QXV1 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cbx8Q9QXV1 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cbx8Q9QXV1 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cbx8Q9QXV1 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cbx8Q9QXV1 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cbx8Q9QXV1 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cbx8Q9QXV1 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cbx8Q9QXV1 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cbx8Q9QXV1 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cbx8Q9QXV1 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cbx8Q9QXV1 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cbx8Q9QXV1 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cbx8Q9QXV1 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cbx8Q9QXV1 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Cbx8Q9QXV1 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cbx8Q9QXV1 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cbx8Q9QXV1 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cbx8Q9QXV1 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cbx8Q9QXV1 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cbx8Q9QXV1 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Cbx8Q9QXV1 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cbx8Q9QXV1 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cbx8Q9QXV1 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cbx8Q9QXV1 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cbx8Q9QXV1 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Cbx8Q9QXV1 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Cbx8Q9QXV1 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cbx8Q9QXV1 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Cbx8Q9QXV1 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cbx8Q9QXV1 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cbx8Q9QXV1 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cbx8Q9QXV1 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cbx8Q9QXV1 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cbx8Q9QXV1 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cbx8Q9QXV1 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Cbx8Q9QXV1 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cbx8Q9QXV1 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cbx8Q9QXV1 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cbx8Q9QXV1 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cbx8Q9QXV1 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cbx8Q9QXV1 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms