Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXV0

Pcsk1n, ProSAAS, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk1nQ9QXV0 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pcsk1nQ9QXV0 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pcsk1nQ9QXV0 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pcsk1nQ9QXV0 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pcsk1nQ9QXV0 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pcsk1nQ9QXV0 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pcsk1nQ9QXV0 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pcsk1nQ9QXV0 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pcsk1nQ9QXV0 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pcsk1nQ9QXV0 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pcsk1nQ9QXV0 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pcsk1nQ9QXV0 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Pcsk1nQ9QXV0 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pcsk1nQ9QXV0 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pcsk1nQ9QXV0 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Pcsk1nQ9QXV0 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pcsk1nQ9QXV0 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pcsk1nQ9QXV0 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pcsk1nQ9QXV0 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pcsk1nQ9QXV0 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pcsk1nQ9QXV0 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pcsk1nQ9QXV0 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pcsk1nQ9QXV0 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pcsk1nQ9QXV0 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pcsk1nQ9QXV0 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pcsk1nQ9QXV0 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pcsk1nQ9QXV0 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pcsk1nQ9QXV0 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pcsk1nQ9QXV0 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pcsk1nQ9QXV0 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pcsk1nQ9QXV0 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Pcsk1nQ9QXV0 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pcsk1nQ9QXV0 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pcsk1nQ9QXV0 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pcsk1nQ9QXV0 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pcsk1nQ9QXV0 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Pcsk1nQ9QXV0 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pcsk1nQ9QXV0 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pcsk1nQ9QXV0 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pcsk1nQ9QXV0 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pcsk1nQ9QXV0 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pcsk1nQ9QXV0 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pcsk1nQ9QXV0 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pcsk1nQ9QXV0 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Pcsk1nQ9QXV0 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pcsk1nQ9QXV0 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pcsk1nQ9QXV0 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pcsk1nQ9QXV0 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pcsk1nQ9QXV0 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pcsk1nQ9QXV0 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pcsk1nQ9QXV0 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Pcsk1nQ9QXV0 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pcsk1nQ9QXV0 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pcsk1nQ9QXV0 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pcsk1nQ9QXV0 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pcsk1nQ9QXV0 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pcsk1nQ9QXV0 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pcsk1nQ9QXV0 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pcsk1nQ9QXV0 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pcsk1nQ9QXV0 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pcsk1nQ9QXV0 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pcsk1nQ9QXV0 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Pcsk1nQ9QXV0 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pcsk1nQ9QXV0 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pcsk1nQ9QXV0 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pcsk1nQ9QXV0 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pcsk1nQ9QXV0 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Pcsk1nQ9QXV0 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pcsk1nQ9QXV0 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pcsk1nQ9QXV0 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pcsk1nQ9QXV0 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pcsk1nQ9QXV0 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pcsk1nQ9QXV0 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pcsk1nQ9QXV0 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pcsk1nQ9QXV0 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pcsk1nQ9QXV0 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pcsk1nQ9QXV0 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pcsk1nQ9QXV0 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pcsk1nQ9QXV0 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pcsk1nQ9QXV0 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pcsk1nQ9QXV0 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pcsk1nQ9QXV0 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pcsk1nQ9QXV0 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pcsk1nQ9QXV0 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pcsk1nQ9QXV0 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pcsk1nQ9QXV0 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pcsk1nQ9QXV0 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pcsk1nQ9QXV0 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pcsk1nQ9QXV0 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pcsk1nQ9QXV0 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pcsk1nQ9QXV0 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pcsk1nQ9QXV0 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Pcsk1nQ9QXV0 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Pcsk1nQ9QXV0 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pcsk1nQ9QXV0 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pcsk1nQ9QXV0 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pcsk1nQ9QXV0 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pcsk1nQ9QXV0 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Pcsk1nQ9QXV0 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Pcsk1nQ9QXV0 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms