Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXT8

Kcnip3, Calsenilin, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip3Q9QXT8 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kcnip3Q9QXT8 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kcnip3Q9QXT8 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Kcnip3Q9QXT8 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kcnip3Q9QXT8 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kcnip3Q9QXT8 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Kcnip3Q9QXT8 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kcnip3Q9QXT8 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kcnip3Q9QXT8 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kcnip3Q9QXT8 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kcnip3Q9QXT8 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kcnip3Q9QXT8 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kcnip3Q9QXT8 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kcnip3Q9QXT8 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kcnip3Q9QXT8 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kcnip3Q9QXT8 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kcnip3Q9QXT8 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kcnip3Q9QXT8 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Kcnip3Q9QXT8 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Kcnip3Q9QXT8 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Kcnip3Q9QXT8 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Kcnip3Q9QXT8 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Kcnip3Q9QXT8 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Kcnip3Q9QXT8 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Kcnip3Q9QXT8 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Kcnip3Q9QXT8 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Kcnip3Q9QXT8 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Kcnip3Q9QXT8 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Kcnip3Q9QXT8 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Kcnip3Q9QXT8 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Kcnip3Q9QXT8 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Kcnip3Q9QXT8 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Kcnip3Q9QXT8 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Kcnip3Q9QXT8 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Kcnip3Q9QXT8 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Kcnip3Q9QXT8 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Kcnip3Q9QXT8 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Kcnip3Q9QXT8 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Kcnip3Q9QXT8 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Kcnip3Q9QXT8 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kcnip3Q9QXT8 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kcnip3Q9QXT8 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kcnip3Q9QXT8 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kcnip3Q9QXT8 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kcnip3Q9QXT8 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kcnip3Q9QXT8 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kcnip3Q9QXT8 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kcnip3Q9QXT8 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kcnip3Q9QXT8 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kcnip3Q9QXT8 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kcnip3Q9QXT8 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kcnip3Q9QXT8 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kcnip3Q9QXT8 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kcnip3Q9QXT8 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kcnip3Q9QXT8 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kcnip3Q9QXT8 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kcnip3Q9QXT8 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kcnip3Q9QXT8 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kcnip3Q9QXT8 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kcnip3Q9QXT8 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kcnip3Q9QXT8 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Kcnip3Q9QXT8 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kcnip3Q9QXT8 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kcnip3Q9QXT8 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kcnip3Q9QXT8 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kcnip3Q9QXT8 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kcnip3Q9QXT8 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kcnip3Q9QXT8 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kcnip3Q9QXT8 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kcnip3Q9QXT8 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kcnip3Q9QXT8 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kcnip3Q9QXT8 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kcnip3Q9QXT8 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kcnip3Q9QXT8 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kcnip3Q9QXT8 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kcnip3Q9QXT8 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kcnip3Q9QXT8 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kcnip3Q9QXT8 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kcnip3Q9QXT8 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kcnip3Q9QXT8 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kcnip3Q9QXT8 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kcnip3Q9QXT8 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kcnip3Q9QXT8 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kcnip3Q9QXT8 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kcnip3Q9QXT8 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kcnip3Q9QXT8 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kcnip3Q9QXT8 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kcnip3Q9QXT8 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kcnip3Q9QXT8 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kcnip3Q9QXT8 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kcnip3Q9QXT8 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kcnip3Q9QXT8 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kcnip3Q9QXT8 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kcnip3Q9QXT8 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kcnip3Q9QXT8 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kcnip3Q9QXT8 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kcnip3Q9QXT8 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Kcnip3Q9QXT8 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kcnip3Q9QXT8 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kcnip3Q9QXT8 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.8 ms