Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXN3

Trip4, Activating signal cointegrator 1, mousemouse

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip4Q9QXN3 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trip4Q9QXN3 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trip4Q9QXN3 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trip4Q9QXN3 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trip4Q9QXN3 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trip4Q9QXN3 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trip4Q9QXN3 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Trip4Q9QXN3 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trip4Q9QXN3 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trip4Q9QXN3 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trip4Q9QXN3 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trip4Q9QXN3 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trip4Q9QXN3 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trip4Q9QXN3 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Trip4Q9QXN3 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
Trip4Q9QXN3 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trip4Q9QXN3 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trip4Q9QXN3 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trip4Q9QXN3 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trip4Q9QXN3 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trip4Q9QXN3 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Trip4Q9QXN3 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trip4Q9QXN3 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trip4Q9QXN3 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trip4Q9QXN3 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trip4Q9QXN3 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Trip4Q9QXN3 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trip4Q9QXN3 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trip4Q9QXN3 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trip4Q9QXN3 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trip4Q9QXN3 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trip4Q9QXN3 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trip4Q9QXN3 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trip4Q9QXN3 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trip4Q9QXN3 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trip4Q9QXN3 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trip4Q9QXN3 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trip4Q9QXN3 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trip4Q9QXN3 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trip4Q9QXN3 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trip4Q9QXN3 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trip4Q9QXN3 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trip4Q9QXN3 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trip4Q9QXN3 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trip4Q9QXN3 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Trip4Q9QXN3 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trip4Q9QXN3 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trip4Q9QXN3 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trip4Q9QXN3 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trip4Q9QXN3 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trip4Q9QXN3 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trip4Q9QXN3 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trip4Q9QXN3 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trip4Q9QXN3 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trip4Q9QXN3 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trip4Q9QXN3 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trip4Q9QXN3 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trip4Q9QXN3 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Trip4Q9QXN3 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trip4Q9QXN3 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trip4Q9QXN3 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trip4Q9QXN3 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trip4Q9QXN3 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trip4Q9QXN3 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trip4Q9QXN3 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trip4Q9QXN3 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trip4Q9QXN3 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trip4Q9QXN3 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trip4Q9QXN3 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trip4Q9QXN3 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trip4Q9QXN3 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trip4Q9QXN3 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trip4Q9QXN3 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trip4Q9QXN3 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trip4Q9QXN3 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trip4Q9QXN3 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trip4Q9QXN3 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trip4Q9QXN3 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trip4Q9QXN3 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trip4Q9QXN3 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trip4Q9QXN3 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trip4Q9QXN3 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trip4Q9QXN3 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trip4Q9QXN3 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trip4Q9QXN3 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trip4Q9QXN3 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trip4Q9QXN3 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trip4Q9QXN3 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trip4Q9QXN3 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trip4Q9QXN3 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trip4Q9QXN3 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Trip4Q9QXN3 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Trip4Q9QXN3 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Trip4Q9QXN3 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Trip4Q9QXN3 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Trip4Q9QXN3 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Trip4Q9QXN3 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Trip4Q9QXN3 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Trip4Q9QXN3 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Trip4Q9QXN3 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 259 ms