Protein–RNA interactions for Protein: Q9QW08

Pdc, Phosducin, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdcQ9QW08 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PdcQ9QW08 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PdcQ9QW08 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PdcQ9QW08 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PdcQ9QW08 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PdcQ9QW08 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PdcQ9QW08 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PdcQ9QW08 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PdcQ9QW08 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PdcQ9QW08 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PdcQ9QW08 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PdcQ9QW08 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PdcQ9QW08 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PdcQ9QW08 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PdcQ9QW08 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PdcQ9QW08 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PdcQ9QW08 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PdcQ9QW08 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PdcQ9QW08 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PdcQ9QW08 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PdcQ9QW08 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PdcQ9QW08 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PdcQ9QW08 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PdcQ9QW08 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PdcQ9QW08 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PdcQ9QW08 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PdcQ9QW08 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PdcQ9QW08 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PdcQ9QW08 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PdcQ9QW08 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PdcQ9QW08 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PdcQ9QW08 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PdcQ9QW08 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PdcQ9QW08 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PdcQ9QW08 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PdcQ9QW08 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PdcQ9QW08 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PdcQ9QW08 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PdcQ9QW08 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PdcQ9QW08 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PdcQ9QW08 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PdcQ9QW08 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PdcQ9QW08 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PdcQ9QW08 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PdcQ9QW08 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PdcQ9QW08 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PdcQ9QW08 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PdcQ9QW08 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PdcQ9QW08 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PdcQ9QW08 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PdcQ9QW08 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PdcQ9QW08 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PdcQ9QW08 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PdcQ9QW08 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PdcQ9QW08 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PdcQ9QW08 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PdcQ9QW08 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PdcQ9QW08 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PdcQ9QW08 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PdcQ9QW08 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PdcQ9QW08 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PdcQ9QW08 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PdcQ9QW08 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PdcQ9QW08 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PdcQ9QW08 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PdcQ9QW08 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PdcQ9QW08 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PdcQ9QW08 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PdcQ9QW08 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PdcQ9QW08 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PdcQ9QW08 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PdcQ9QW08 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PdcQ9QW08 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PdcQ9QW08 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PdcQ9QW08 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PdcQ9QW08 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PdcQ9QW08 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PdcQ9QW08 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PdcQ9QW08 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PdcQ9QW08 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PdcQ9QW08 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PdcQ9QW08 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PdcQ9QW08 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PdcQ9QW08 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PdcQ9QW08 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PdcQ9QW08 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PdcQ9QW08 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PdcQ9QW08 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PdcQ9QW08 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PdcQ9QW08 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PdcQ9QW08 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PdcQ9QW08 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PdcQ9QW08 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PdcQ9QW08 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PdcQ9QW08 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PdcQ9QW08 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PdcQ9QW08 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PdcQ9QW08 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PdcQ9QW08 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PdcQ9QW08 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms