Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK3

Cln8, Protein CLN8, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln8Q9QUK3 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cln8Q9QUK3 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cln8Q9QUK3 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cln8Q9QUK3 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cln8Q9QUK3 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cln8Q9QUK3 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cln8Q9QUK3 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cln8Q9QUK3 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cln8Q9QUK3 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cln8Q9QUK3 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cln8Q9QUK3 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cln8Q9QUK3 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cln8Q9QUK3 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cln8Q9QUK3 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cln8Q9QUK3 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cln8Q9QUK3 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cln8Q9QUK3 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cln8Q9QUK3 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cln8Q9QUK3 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cln8Q9QUK3 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cln8Q9QUK3 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cln8Q9QUK3 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Cln8Q9QUK3 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cln8Q9QUK3 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cln8Q9QUK3 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Cln8Q9QUK3 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cln8Q9QUK3 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cln8Q9QUK3 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cln8Q9QUK3 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cln8Q9QUK3 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cln8Q9QUK3 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Cln8Q9QUK3 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cln8Q9QUK3 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cln8Q9QUK3 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cln8Q9QUK3 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cln8Q9QUK3 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cln8Q9QUK3 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Cln8Q9QUK3 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cln8Q9QUK3 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cln8Q9QUK3 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cln8Q9QUK3 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cln8Q9QUK3 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cln8Q9QUK3 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cln8Q9QUK3 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cln8Q9QUK3 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cln8Q9QUK3 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cln8Q9QUK3 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cln8Q9QUK3 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cln8Q9QUK3 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cln8Q9QUK3 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cln8Q9QUK3 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cln8Q9QUK3 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cln8Q9QUK3 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cln8Q9QUK3 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cln8Q9QUK3 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cln8Q9QUK3 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cln8Q9QUK3 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cln8Q9QUK3 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cln8Q9QUK3 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cln8Q9QUK3 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Cln8Q9QUK3 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cln8Q9QUK3 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cln8Q9QUK3 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cln8Q9QUK3 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cln8Q9QUK3 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cln8Q9QUK3 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cln8Q9QUK3 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cln8Q9QUK3 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cln8Q9QUK3 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cln8Q9QUK3 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cln8Q9QUK3 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cln8Q9QUK3 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cln8Q9QUK3 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cln8Q9QUK3 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cln8Q9QUK3 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cln8Q9QUK3 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cln8Q9QUK3 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cln8Q9QUK3 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Cln8Q9QUK3 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cln8Q9QUK3 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cln8Q9QUK3 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cln8Q9QUK3 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cln8Q9QUK3 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cln8Q9QUK3 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cln8Q9QUK3 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cln8Q9QUK3 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cln8Q9QUK3 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cln8Q9QUK3 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cln8Q9QUK3 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cln8Q9QUK3 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cln8Q9QUK3 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cln8Q9QUK3 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cln8Q9QUK3 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cln8Q9QUK3 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cln8Q9QUK3 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cln8Q9QUK3 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cln8Q9QUK3 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cln8Q9QUK3 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Cln8Q9QUK3 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cln8Q9QUK3 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms