Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUI0

Rhoa, Transforming protein RhoA, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoaQ9QUI0 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RhoaQ9QUI0 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RhoaQ9QUI0 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
RhoaQ9QUI0 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RhoaQ9QUI0 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RhoaQ9QUI0 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RhoaQ9QUI0 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
RhoaQ9QUI0 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RhoaQ9QUI0 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RhoaQ9QUI0 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RhoaQ9QUI0 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RhoaQ9QUI0 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RhoaQ9QUI0 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RhoaQ9QUI0 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RhoaQ9QUI0 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RhoaQ9QUI0 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RhoaQ9QUI0 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RhoaQ9QUI0 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
RhoaQ9QUI0 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RhoaQ9QUI0 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RhoaQ9QUI0 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RhoaQ9QUI0 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RhoaQ9QUI0 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RhoaQ9QUI0 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RhoaQ9QUI0 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RhoaQ9QUI0 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RhoaQ9QUI0 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RhoaQ9QUI0 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RhoaQ9QUI0 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RhoaQ9QUI0 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RhoaQ9QUI0 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
RhoaQ9QUI0 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RhoaQ9QUI0 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RhoaQ9QUI0 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RhoaQ9QUI0 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RhoaQ9QUI0 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RhoaQ9QUI0 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RhoaQ9QUI0 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
RhoaQ9QUI0 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
RhoaQ9QUI0 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
RhoaQ9QUI0 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
RhoaQ9QUI0 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
RhoaQ9QUI0 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RhoaQ9QUI0 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RhoaQ9QUI0 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RhoaQ9QUI0 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RhoaQ9QUI0 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
RhoaQ9QUI0 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
RhoaQ9QUI0 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RhoaQ9QUI0 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RhoaQ9QUI0 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RhoaQ9QUI0 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RhoaQ9QUI0 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RhoaQ9QUI0 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RhoaQ9QUI0 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RhoaQ9QUI0 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RhoaQ9QUI0 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RhoaQ9QUI0 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RhoaQ9QUI0 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RhoaQ9QUI0 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RhoaQ9QUI0 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RhoaQ9QUI0 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RhoaQ9QUI0 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RhoaQ9QUI0 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RhoaQ9QUI0 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RhoaQ9QUI0 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RhoaQ9QUI0 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RhoaQ9QUI0 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RhoaQ9QUI0 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RhoaQ9QUI0 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RhoaQ9QUI0 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RhoaQ9QUI0 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RhoaQ9QUI0 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RhoaQ9QUI0 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RhoaQ9QUI0 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RhoaQ9QUI0 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RhoaQ9QUI0 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RhoaQ9QUI0 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RhoaQ9QUI0 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RhoaQ9QUI0 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RhoaQ9QUI0 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RhoaQ9QUI0 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RhoaQ9QUI0 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RhoaQ9QUI0 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RhoaQ9QUI0 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RhoaQ9QUI0 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RhoaQ9QUI0 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
RhoaQ9QUI0 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RhoaQ9QUI0 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
RhoaQ9QUI0 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RhoaQ9QUI0 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
RhoaQ9QUI0 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RhoaQ9QUI0 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RhoaQ9QUI0 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RhoaQ9QUI0 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RhoaQ9QUI0 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RhoaQ9QUI0 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RhoaQ9QUI0 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RhoaQ9QUI0 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RhoaQ9QUI0 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 119.3 ms