Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMK2

Csnk1e, Casein kinase I isoform epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1eQ9JMK2 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Csnk1eQ9JMK2 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Csnk1eQ9JMK2 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Csnk1eQ9JMK2 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Csnk1eQ9JMK2 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Csnk1eQ9JMK2 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Csnk1eQ9JMK2 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Csnk1eQ9JMK2 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Csnk1eQ9JMK2 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Csnk1eQ9JMK2 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Csnk1eQ9JMK2 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Csnk1eQ9JMK2 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Csnk1eQ9JMK2 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Csnk1eQ9JMK2 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Csnk1eQ9JMK2 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Csnk1eQ9JMK2 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Csnk1eQ9JMK2 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Csnk1eQ9JMK2 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Csnk1eQ9JMK2 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Csnk1eQ9JMK2 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Csnk1eQ9JMK2 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Csnk1eQ9JMK2 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Csnk1eQ9JMK2 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Csnk1eQ9JMK2 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Csnk1eQ9JMK2 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Csnk1eQ9JMK2 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Csnk1eQ9JMK2 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Csnk1eQ9JMK2 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Csnk1eQ9JMK2 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Csnk1eQ9JMK2 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Csnk1eQ9JMK2 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Csnk1eQ9JMK2 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Csnk1eQ9JMK2 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Csnk1eQ9JMK2 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Csnk1eQ9JMK2 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Csnk1eQ9JMK2 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Csnk1eQ9JMK2 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Csnk1eQ9JMK2 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Csnk1eQ9JMK2 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Csnk1eQ9JMK2 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Csnk1eQ9JMK2 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Csnk1eQ9JMK2 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Csnk1eQ9JMK2 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Csnk1eQ9JMK2 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Csnk1eQ9JMK2 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Csnk1eQ9JMK2 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Csnk1eQ9JMK2 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Csnk1eQ9JMK2 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Csnk1eQ9JMK2 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Csnk1eQ9JMK2 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Csnk1eQ9JMK2 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Csnk1eQ9JMK2 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Csnk1eQ9JMK2 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Csnk1eQ9JMK2 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Csnk1eQ9JMK2 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Csnk1eQ9JMK2 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Csnk1eQ9JMK2 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Csnk1eQ9JMK2 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Csnk1eQ9JMK2 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Csnk1eQ9JMK2 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Csnk1eQ9JMK2 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Csnk1eQ9JMK2 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Csnk1eQ9JMK2 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Csnk1eQ9JMK2 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Csnk1eQ9JMK2 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Csnk1eQ9JMK2 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Csnk1eQ9JMK2 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Csnk1eQ9JMK2 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Csnk1eQ9JMK2 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Csnk1eQ9JMK2 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Csnk1eQ9JMK2 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Csnk1eQ9JMK2 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Csnk1eQ9JMK2 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Csnk1eQ9JMK2 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Csnk1eQ9JMK2 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Csnk1eQ9JMK2 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Csnk1eQ9JMK2 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Csnk1eQ9JMK2 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Csnk1eQ9JMK2 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Csnk1eQ9JMK2 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Csnk1eQ9JMK2 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Csnk1eQ9JMK2 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Csnk1eQ9JMK2 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Csnk1eQ9JMK2 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Csnk1eQ9JMK2 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Csnk1eQ9JMK2 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Csnk1eQ9JMK2 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Csnk1eQ9JMK2 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Csnk1eQ9JMK2 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Csnk1eQ9JMK2 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Csnk1eQ9JMK2 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Csnk1eQ9JMK2 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Csnk1eQ9JMK2 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Csnk1eQ9JMK2 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Csnk1eQ9JMK2 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Csnk1eQ9JMK2 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Csnk1eQ9JMK2 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Csnk1eQ9JMK2 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Csnk1eQ9JMK2 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Csnk1eQ9JMK2 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms