Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rabgef1Q9JM13 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rabgef1Q9JM13 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rabgef1Q9JM13 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rabgef1Q9JM13 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rabgef1Q9JM13 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Rabgef1Q9JM13 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rabgef1Q9JM13 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rabgef1Q9JM13 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rabgef1Q9JM13 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rabgef1Q9JM13 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rabgef1Q9JM13 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rabgef1Q9JM13 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rabgef1Q9JM13 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rabgef1Q9JM13 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rabgef1Q9JM13 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rabgef1Q9JM13 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rabgef1Q9JM13 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rabgef1Q9JM13 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rabgef1Q9JM13 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rabgef1Q9JM13 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rabgef1Q9JM13 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rabgef1Q9JM13 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rabgef1Q9JM13 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rabgef1Q9JM13 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rabgef1Q9JM13 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rabgef1Q9JM13 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rabgef1Q9JM13 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rabgef1Q9JM13 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rabgef1Q9JM13 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rabgef1Q9JM13 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rabgef1Q9JM13 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rabgef1Q9JM13 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rabgef1Q9JM13 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Rabgef1Q9JM13 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rabgef1Q9JM13 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rabgef1Q9JM13 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rabgef1Q9JM13 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rabgef1Q9JM13 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rabgef1Q9JM13 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rabgef1Q9JM13 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rabgef1Q9JM13 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rabgef1Q9JM13 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Rabgef1Q9JM13 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rabgef1Q9JM13 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Rabgef1Q9JM13 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Rabgef1Q9JM13 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Rabgef1Q9JM13 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Rabgef1Q9JM13 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rabgef1Q9JM13 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rabgef1Q9JM13 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rabgef1Q9JM13 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rabgef1Q9JM13 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rabgef1Q9JM13 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rabgef1Q9JM13 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rabgef1Q9JM13 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rabgef1Q9JM13 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rabgef1Q9JM13 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rabgef1Q9JM13 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Rabgef1Q9JM13 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rabgef1Q9JM13 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rabgef1Q9JM13 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rabgef1Q9JM13 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rabgef1Q9JM13 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Rabgef1Q9JM13 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rabgef1Q9JM13 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rabgef1Q9JM13 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rabgef1Q9JM13 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rabgef1Q9JM13 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rabgef1Q9JM13 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rabgef1Q9JM13 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rabgef1Q9JM13 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rabgef1Q9JM13 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rabgef1Q9JM13 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rabgef1Q9JM13 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rabgef1Q9JM13 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rabgef1Q9JM13 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rabgef1Q9JM13 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rabgef1Q9JM13 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rabgef1Q9JM13 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rabgef1Q9JM13 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rabgef1Q9JM13 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rabgef1Q9JM13 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rabgef1Q9JM13 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rabgef1Q9JM13 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rabgef1Q9JM13 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rabgef1Q9JM13 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rabgef1Q9JM13 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rabgef1Q9JM13 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rabgef1Q9JM13 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rabgef1Q9JM13 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rabgef1Q9JM13 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rabgef1Q9JM13 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rabgef1Q9JM13 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rabgef1Q9JM13 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rabgef1Q9JM13 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rabgef1Q9JM13 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rabgef1Q9JM13 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Rabgef1Q9JM13 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rabgef1Q9JM13 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms