Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLL3

Tnfrsf19, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 19, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf19Q9JLL3 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfrsf19Q9JLL3 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfrsf19Q9JLL3 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfrsf19Q9JLL3 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfrsf19Q9JLL3 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfrsf19Q9JLL3 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfrsf19Q9JLL3 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfrsf19Q9JLL3 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfrsf19Q9JLL3 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfrsf19Q9JLL3 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfrsf19Q9JLL3 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfrsf19Q9JLL3 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfrsf19Q9JLL3 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfrsf19Q9JLL3 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfrsf19Q9JLL3 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfrsf19Q9JLL3 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfrsf19Q9JLL3 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfrsf19Q9JLL3 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfrsf19Q9JLL3 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfrsf19Q9JLL3 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfrsf19Q9JLL3 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfrsf19Q9JLL3 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfrsf19Q9JLL3 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfrsf19Q9JLL3 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfrsf19Q9JLL3 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfrsf19Q9JLL3 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfrsf19Q9JLL3 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfrsf19Q9JLL3 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfrsf19Q9JLL3 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfrsf19Q9JLL3 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfrsf19Q9JLL3 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfrsf19Q9JLL3 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfrsf19Q9JLL3 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfrsf19Q9JLL3 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfrsf19Q9JLL3 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfrsf19Q9JLL3 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfrsf19Q9JLL3 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfrsf19Q9JLL3 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfrsf19Q9JLL3 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfrsf19Q9JLL3 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfrsf19Q9JLL3 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfrsf19Q9JLL3 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfrsf19Q9JLL3 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfrsf19Q9JLL3 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfrsf19Q9JLL3 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfrsf19Q9JLL3 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfrsf19Q9JLL3 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfrsf19Q9JLL3 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfrsf19Q9JLL3 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfrsf19Q9JLL3 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfrsf19Q9JLL3 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfrsf19Q9JLL3 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfrsf19Q9JLL3 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfrsf19Q9JLL3 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfrsf19Q9JLL3 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfrsf19Q9JLL3 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfrsf19Q9JLL3 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfrsf19Q9JLL3 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnfrsf19Q9JLL3 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnfrsf19Q9JLL3 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnfrsf19Q9JLL3 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnfrsf19Q9JLL3 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnfrsf19Q9JLL3 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnfrsf19Q9JLL3 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnfrsf19Q9JLL3 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnfrsf19Q9JLL3 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnfrsf19Q9JLL3 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnfrsf19Q9JLL3 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnfrsf19Q9JLL3 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnfrsf19Q9JLL3 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnfrsf19Q9JLL3 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnfrsf19Q9JLL3 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnfrsf19Q9JLL3 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnfrsf19Q9JLL3 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnfrsf19Q9JLL3 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnfrsf19Q9JLL3 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnfrsf19Q9JLL3 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnfrsf19Q9JLL3 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnfrsf19Q9JLL3 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnfrsf19Q9JLL3 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnfrsf19Q9JLL3 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnfrsf19Q9JLL3 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnfrsf19Q9JLL3 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnfrsf19Q9JLL3 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnfrsf19Q9JLL3 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnfrsf19Q9JLL3 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnfrsf19Q9JLL3 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnfrsf19Q9JLL3 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnfrsf19Q9JLL3 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnfrsf19Q9JLL3 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnfrsf19Q9JLL3 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnfrsf19Q9JLL3 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnfrsf19Q9JLL3 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnfrsf19Q9JLL3 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms