Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLH8

Tmod4, Tropomodulin-4, mousemouse

Predictions only

Length 345 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod4Q9JLH8 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tmod4Q9JLH8 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tmod4Q9JLH8 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tmod4Q9JLH8 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Tmod4Q9JLH8 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tmod4Q9JLH8 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tmod4Q9JLH8 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Tmod4Q9JLH8 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Tmod4Q9JLH8 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tmod4Q9JLH8 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tmod4Q9JLH8 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tmod4Q9JLH8 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tmod4Q9JLH8 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tmod4Q9JLH8 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tmod4Q9JLH8 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tmod4Q9JLH8 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tmod4Q9JLH8 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Tmod4Q9JLH8 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tmod4Q9JLH8 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tmod4Q9JLH8 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tmod4Q9JLH8 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tmod4Q9JLH8 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tmod4Q9JLH8 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tmod4Q9JLH8 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tmod4Q9JLH8 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tmod4Q9JLH8 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tmod4Q9JLH8 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tmod4Q9JLH8 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tmod4Q9JLH8 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tmod4Q9JLH8 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Tmod4Q9JLH8 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tmod4Q9JLH8 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tmod4Q9JLH8 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tmod4Q9JLH8 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tmod4Q9JLH8 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tmod4Q9JLH8 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Tmod4Q9JLH8 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Tmod4Q9JLH8 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tmod4Q9JLH8 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tmod4Q9JLH8 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tmod4Q9JLH8 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tmod4Q9JLH8 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tmod4Q9JLH8 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Tmod4Q9JLH8 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Tmod4Q9JLH8 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tmod4Q9JLH8 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tmod4Q9JLH8 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tmod4Q9JLH8 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tmod4Q9JLH8 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tmod4Q9JLH8 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tmod4Q9JLH8 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tmod4Q9JLH8 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tmod4Q9JLH8 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tmod4Q9JLH8 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tmod4Q9JLH8 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tmod4Q9JLH8 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tmod4Q9JLH8 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tmod4Q9JLH8 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tmod4Q9JLH8 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tmod4Q9JLH8 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Tmod4Q9JLH8 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Tmod4Q9JLH8 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tmod4Q9JLH8 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tmod4Q9JLH8 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tmod4Q9JLH8 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tmod4Q9JLH8 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tmod4Q9JLH8 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tmod4Q9JLH8 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tmod4Q9JLH8 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tmod4Q9JLH8 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tmod4Q9JLH8 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tmod4Q9JLH8 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tmod4Q9JLH8 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tmod4Q9JLH8 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tmod4Q9JLH8 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tmod4Q9JLH8 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tmod4Q9JLH8 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tmod4Q9JLH8 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tmod4Q9JLH8 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tmod4Q9JLH8 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tmod4Q9JLH8 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tmod4Q9JLH8 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Tmod4Q9JLH8 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tmod4Q9JLH8 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tmod4Q9JLH8 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tmod4Q9JLH8 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tmod4Q9JLH8 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tmod4Q9JLH8 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tmod4Q9JLH8 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tmod4Q9JLH8 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tmod4Q9JLH8 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tmod4Q9JLH8 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tmod4Q9JLH8 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tmod4Q9JLH8 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tmod4Q9JLH8 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tmod4Q9JLH8 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tmod4Q9JLH8 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tmod4Q9JLH8 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Tmod4Q9JLH8 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tmod4Q9JLH8 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms