Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL70

Fanca, Fanconi anemia group A protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FancaQ9JL70 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
FancaQ9JL70 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FancaQ9JL70 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FancaQ9JL70 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FancaQ9JL70 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FancaQ9JL70 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FancaQ9JL70 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FancaQ9JL70 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FancaQ9JL70 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FancaQ9JL70 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FancaQ9JL70 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FancaQ9JL70 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FancaQ9JL70 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
FancaQ9JL70 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FancaQ9JL70 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FancaQ9JL70 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FancaQ9JL70 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FancaQ9JL70 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FancaQ9JL70 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
FancaQ9JL70 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
FancaQ9JL70 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FancaQ9JL70 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FancaQ9JL70 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FancaQ9JL70 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FancaQ9JL70 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FancaQ9JL70 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FancaQ9JL70 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
FancaQ9JL70 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FancaQ9JL70 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FancaQ9JL70 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FancaQ9JL70 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FancaQ9JL70 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FancaQ9JL70 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FancaQ9JL70 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FancaQ9JL70 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FancaQ9JL70 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FancaQ9JL70 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FancaQ9JL70 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FancaQ9JL70 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FancaQ9JL70 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FancaQ9JL70 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FancaQ9JL70 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FancaQ9JL70 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FancaQ9JL70 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FancaQ9JL70 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FancaQ9JL70 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FancaQ9JL70 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FancaQ9JL70 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FancaQ9JL70 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FancaQ9JL70 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FancaQ9JL70 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FancaQ9JL70 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FancaQ9JL70 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
FancaQ9JL70 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FancaQ9JL70 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FancaQ9JL70 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FancaQ9JL70 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FancaQ9JL70 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FancaQ9JL70 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FancaQ9JL70 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
FancaQ9JL70 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
FancaQ9JL70 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FancaQ9JL70 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FancaQ9JL70 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FancaQ9JL70 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FancaQ9JL70 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FancaQ9JL70 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
FancaQ9JL70 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
FancaQ9JL70 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
FancaQ9JL70 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
FancaQ9JL70 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
FancaQ9JL70 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
FancaQ9JL70 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
FancaQ9JL70 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
FancaQ9JL70 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
FancaQ9JL70 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
FancaQ9JL70 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FancaQ9JL70 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FancaQ9JL70 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FancaQ9JL70 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FancaQ9JL70 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FancaQ9JL70 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FancaQ9JL70 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FancaQ9JL70 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FancaQ9JL70 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FancaQ9JL70 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FancaQ9JL70 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FancaQ9JL70 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FancaQ9JL70 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FancaQ9JL70 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
FancaQ9JL70 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FancaQ9JL70 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FancaQ9JL70 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FancaQ9JL70 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FancaQ9JL70 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FancaQ9JL70 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FancaQ9JL70 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FancaQ9JL70 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FancaQ9JL70 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FancaQ9JL70 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms