Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL56

Gde1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gde1Q9JL56 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gde1Q9JL56 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Gde1Q9JL56 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gde1Q9JL56 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gde1Q9JL56 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gde1Q9JL56 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gde1Q9JL56 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gde1Q9JL56 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gde1Q9JL56 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gde1Q9JL56 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gde1Q9JL56 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gde1Q9JL56 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Gde1Q9JL56 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gde1Q9JL56 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gde1Q9JL56 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gde1Q9JL56 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gde1Q9JL56 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gde1Q9JL56 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gde1Q9JL56 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gde1Q9JL56 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gde1Q9JL56 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gde1Q9JL56 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gde1Q9JL56 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gde1Q9JL56 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gde1Q9JL56 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gde1Q9JL56 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gde1Q9JL56 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Gde1Q9JL56 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gde1Q9JL56 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gde1Q9JL56 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gde1Q9JL56 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gde1Q9JL56 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gde1Q9JL56 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gde1Q9JL56 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gde1Q9JL56 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gde1Q9JL56 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gde1Q9JL56 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gde1Q9JL56 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Gde1Q9JL56 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gde1Q9JL56 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gde1Q9JL56 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gde1Q9JL56 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gde1Q9JL56 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gde1Q9JL56 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gde1Q9JL56 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gde1Q9JL56 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gde1Q9JL56 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gde1Q9JL56 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gde1Q9JL56 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gde1Q9JL56 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gde1Q9JL56 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gde1Q9JL56 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gde1Q9JL56 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gde1Q9JL56 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Gde1Q9JL56 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gde1Q9JL56 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gde1Q9JL56 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gde1Q9JL56 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gde1Q9JL56 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gde1Q9JL56 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gde1Q9JL56 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gde1Q9JL56 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Gde1Q9JL56 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gde1Q9JL56 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gde1Q9JL56 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gde1Q9JL56 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gde1Q9JL56 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gde1Q9JL56 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gde1Q9JL56 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gde1Q9JL56 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gde1Q9JL56 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gde1Q9JL56 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gde1Q9JL56 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gde1Q9JL56 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gde1Q9JL56 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gde1Q9JL56 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gde1Q9JL56 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gde1Q9JL56 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gde1Q9JL56 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gde1Q9JL56 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gde1Q9JL56 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gde1Q9JL56 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gde1Q9JL56 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Gde1Q9JL56 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gde1Q9JL56 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gde1Q9JL56 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gde1Q9JL56 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gde1Q9JL56 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gde1Q9JL56 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gde1Q9JL56 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gde1Q9JL56 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gde1Q9JL56 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gde1Q9JL56 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gde1Q9JL56 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gde1Q9JL56 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gde1Q9JL56 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gde1Q9JL56 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gde1Q9JL56 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gde1Q9JL56 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gde1Q9JL56 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms