Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKZ2

Slc5a3, Sodium/myo-inositol cotransporter, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a3Q9JKZ2 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Slc5a3Q9JKZ2 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Slc5a3Q9JKZ2 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Slc5a3Q9JKZ2 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Slc5a3Q9JKZ2 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Slc5a3Q9JKZ2 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Slc5a3Q9JKZ2 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Slc5a3Q9JKZ2 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Slc5a3Q9JKZ2 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Slc5a3Q9JKZ2 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Slc5a3Q9JKZ2 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Slc5a3Q9JKZ2 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Slc5a3Q9JKZ2 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Slc5a3Q9JKZ2 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Slc5a3Q9JKZ2 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Slc5a3Q9JKZ2 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Slc5a3Q9JKZ2 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Slc5a3Q9JKZ2 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Slc5a3Q9JKZ2 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Slc5a3Q9JKZ2 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Slc5a3Q9JKZ2 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Slc5a3Q9JKZ2 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Slc5a3Q9JKZ2 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Slc5a3Q9JKZ2 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Slc5a3Q9JKZ2 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Slc5a3Q9JKZ2 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Slc5a3Q9JKZ2 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Slc5a3Q9JKZ2 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Slc5a3Q9JKZ2 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Slc5a3Q9JKZ2 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Slc5a3Q9JKZ2 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Slc5a3Q9JKZ2 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Slc5a3Q9JKZ2 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Slc5a3Q9JKZ2 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Slc5a3Q9JKZ2 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Slc5a3Q9JKZ2 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Slc5a3Q9JKZ2 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Slc5a3Q9JKZ2 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Slc5a3Q9JKZ2 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Slc5a3Q9JKZ2 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Slc5a3Q9JKZ2 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Slc5a3Q9JKZ2 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Slc5a3Q9JKZ2 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Slc5a3Q9JKZ2 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Slc5a3Q9JKZ2 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Slc5a3Q9JKZ2 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Slc5a3Q9JKZ2 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Slc5a3Q9JKZ2 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Slc5a3Q9JKZ2 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Slc5a3Q9JKZ2 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Slc5a3Q9JKZ2 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Slc5a3Q9JKZ2 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Slc5a3Q9JKZ2 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Slc5a3Q9JKZ2 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Slc5a3Q9JKZ2 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Slc5a3Q9JKZ2 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Slc5a3Q9JKZ2 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Slc5a3Q9JKZ2 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Slc5a3Q9JKZ2 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Slc5a3Q9JKZ2 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Slc5a3Q9JKZ2 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Slc5a3Q9JKZ2 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Slc5a3Q9JKZ2 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Slc5a3Q9JKZ2 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Slc5a3Q9JKZ2 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Slc5a3Q9JKZ2 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Slc5a3Q9JKZ2 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Slc5a3Q9JKZ2 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Slc5a3Q9JKZ2 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Slc5a3Q9JKZ2 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Slc5a3Q9JKZ2 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Slc5a3Q9JKZ2 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Slc5a3Q9JKZ2 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Slc5a3Q9JKZ2 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Slc5a3Q9JKZ2 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Slc5a3Q9JKZ2 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Slc5a3Q9JKZ2 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Slc5a3Q9JKZ2 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Slc5a3Q9JKZ2 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Slc5a3Q9JKZ2 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Slc5a3Q9JKZ2 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Slc5a3Q9JKZ2 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Slc5a3Q9JKZ2 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Slc5a3Q9JKZ2 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Slc5a3Q9JKZ2 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Slc5a3Q9JKZ2 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Slc5a3Q9JKZ2 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Slc5a3Q9JKZ2 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Slc5a3Q9JKZ2 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Slc5a3Q9JKZ2 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Slc5a3Q9JKZ2 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Slc5a3Q9JKZ2 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Slc5a3Q9JKZ2 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Slc5a3Q9JKZ2 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Slc5a3Q9JKZ2 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Slc5a3Q9JKZ2 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Slc5a3Q9JKZ2 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Slc5a3Q9JKZ2 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Slc5a3Q9JKZ2 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Slc5a3Q9JKZ2 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms