Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKY0

Cnot9, CCR4-NOT transcription complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot9Q9JKY0 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cnot9Q9JKY0 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cnot9Q9JKY0 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cnot9Q9JKY0 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cnot9Q9JKY0 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cnot9Q9JKY0 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cnot9Q9JKY0 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cnot9Q9JKY0 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cnot9Q9JKY0 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cnot9Q9JKY0 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cnot9Q9JKY0 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cnot9Q9JKY0 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cnot9Q9JKY0 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cnot9Q9JKY0 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cnot9Q9JKY0 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cnot9Q9JKY0 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cnot9Q9JKY0 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cnot9Q9JKY0 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cnot9Q9JKY0 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Cnot9Q9JKY0 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cnot9Q9JKY0 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cnot9Q9JKY0 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Cnot9Q9JKY0 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cnot9Q9JKY0 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cnot9Q9JKY0 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cnot9Q9JKY0 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cnot9Q9JKY0 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cnot9Q9JKY0 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cnot9Q9JKY0 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cnot9Q9JKY0 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cnot9Q9JKY0 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cnot9Q9JKY0 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cnot9Q9JKY0 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cnot9Q9JKY0 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cnot9Q9JKY0 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cnot9Q9JKY0 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cnot9Q9JKY0 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cnot9Q9JKY0 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cnot9Q9JKY0 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cnot9Q9JKY0 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cnot9Q9JKY0 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cnot9Q9JKY0 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cnot9Q9JKY0 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cnot9Q9JKY0 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cnot9Q9JKY0 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cnot9Q9JKY0 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cnot9Q9JKY0 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cnot9Q9JKY0 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cnot9Q9JKY0 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cnot9Q9JKY0 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cnot9Q9JKY0 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cnot9Q9JKY0 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Cnot9Q9JKY0 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cnot9Q9JKY0 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cnot9Q9JKY0 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cnot9Q9JKY0 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cnot9Q9JKY0 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cnot9Q9JKY0 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cnot9Q9JKY0 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cnot9Q9JKY0 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cnot9Q9JKY0 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cnot9Q9JKY0 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cnot9Q9JKY0 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cnot9Q9JKY0 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cnot9Q9JKY0 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cnot9Q9JKY0 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cnot9Q9JKY0 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cnot9Q9JKY0 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cnot9Q9JKY0 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Cnot9Q9JKY0 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cnot9Q9JKY0 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cnot9Q9JKY0 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cnot9Q9JKY0 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cnot9Q9JKY0 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cnot9Q9JKY0 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cnot9Q9JKY0 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cnot9Q9JKY0 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cnot9Q9JKY0 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cnot9Q9JKY0 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cnot9Q9JKY0 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cnot9Q9JKY0 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cnot9Q9JKY0 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cnot9Q9JKY0 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cnot9Q9JKY0 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cnot9Q9JKY0 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cnot9Q9JKY0 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Cnot9Q9JKY0 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cnot9Q9JKY0 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cnot9Q9JKY0 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cnot9Q9JKY0 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cnot9Q9JKY0 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cnot9Q9JKY0 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cnot9Q9JKY0 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cnot9Q9JKY0 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cnot9Q9JKY0 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cnot9Q9JKY0 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cnot9Q9JKY0 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cnot9Q9JKY0 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cnot9Q9JKY0 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cnot9Q9JKY0 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms