Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK1

Stx6, Syntaxin-6, mousemouse

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx6Q9JKK1 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Stx6Q9JKK1 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Stx6Q9JKK1 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Stx6Q9JKK1 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Stx6Q9JKK1 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Stx6Q9JKK1 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Stx6Q9JKK1 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Stx6Q9JKK1 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Stx6Q9JKK1 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Stx6Q9JKK1 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Stx6Q9JKK1 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Stx6Q9JKK1 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Stx6Q9JKK1 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Stx6Q9JKK1 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Stx6Q9JKK1 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Stx6Q9JKK1 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Stx6Q9JKK1 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Stx6Q9JKK1 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Stx6Q9JKK1 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Stx6Q9JKK1 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Stx6Q9JKK1 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Stx6Q9JKK1 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Stx6Q9JKK1 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Stx6Q9JKK1 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Stx6Q9JKK1 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Stx6Q9JKK1 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Stx6Q9JKK1 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Stx6Q9JKK1 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Stx6Q9JKK1 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Stx6Q9JKK1 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Stx6Q9JKK1 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Stx6Q9JKK1 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Stx6Q9JKK1 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Stx6Q9JKK1 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Stx6Q9JKK1 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Stx6Q9JKK1 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Stx6Q9JKK1 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Stx6Q9JKK1 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Stx6Q9JKK1 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Stx6Q9JKK1 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Stx6Q9JKK1 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Stx6Q9JKK1 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Stx6Q9JKK1 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Stx6Q9JKK1 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Stx6Q9JKK1 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Stx6Q9JKK1 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Stx6Q9JKK1 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Stx6Q9JKK1 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Stx6Q9JKK1 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Stx6Q9JKK1 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Stx6Q9JKK1 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Stx6Q9JKK1 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Stx6Q9JKK1 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Stx6Q9JKK1 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Stx6Q9JKK1 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Stx6Q9JKK1 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Stx6Q9JKK1 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Stx6Q9JKK1 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Stx6Q9JKK1 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Stx6Q9JKK1 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Stx6Q9JKK1 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Stx6Q9JKK1 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Stx6Q9JKK1 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Stx6Q9JKK1 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Stx6Q9JKK1 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Stx6Q9JKK1 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Stx6Q9JKK1 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Stx6Q9JKK1 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Stx6Q9JKK1 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Stx6Q9JKK1 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Stx6Q9JKK1 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Stx6Q9JKK1 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Stx6Q9JKK1 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Stx6Q9JKK1 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Stx6Q9JKK1 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Stx6Q9JKK1 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Stx6Q9JKK1 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Stx6Q9JKK1 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Stx6Q9JKK1 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Stx6Q9JKK1 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Stx6Q9JKK1 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Stx6Q9JKK1 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Stx6Q9JKK1 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Stx6Q9JKK1 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Stx6Q9JKK1 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Stx6Q9JKK1 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Stx6Q9JKK1 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Stx6Q9JKK1 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Stx6Q9JKK1 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Stx6Q9JKK1 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Stx6Q9JKK1 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Stx6Q9JKK1 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Stx6Q9JKK1 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Stx6Q9JKK1 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Stx6Q9JKK1 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Stx6Q9JKK1 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Stx6Q9JKK1 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Stx6Q9JKK1 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Stx6Q9JKK1 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Stx6Q9JKK1 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms