Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKJ9

Cyp39a1, 24-hydroxycholesterol 7-alpha-hydroxylase, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp39a1Q9JKJ9 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cyp39a1Q9JKJ9 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Cyp39a1Q9JKJ9 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cyp39a1Q9JKJ9 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cyp39a1Q9JKJ9 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cyp39a1Q9JKJ9 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Cyp39a1Q9JKJ9 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cyp39a1Q9JKJ9 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cyp39a1Q9JKJ9 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cyp39a1Q9JKJ9 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cyp39a1Q9JKJ9 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Cyp39a1Q9JKJ9 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cyp39a1Q9JKJ9 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cyp39a1Q9JKJ9 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cyp39a1Q9JKJ9 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cyp39a1Q9JKJ9 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cyp39a1Q9JKJ9 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cyp39a1Q9JKJ9 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cyp39a1Q9JKJ9 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cyp39a1Q9JKJ9 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cyp39a1Q9JKJ9 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cyp39a1Q9JKJ9 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cyp39a1Q9JKJ9 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cyp39a1Q9JKJ9 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cyp39a1Q9JKJ9 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cyp39a1Q9JKJ9 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cyp39a1Q9JKJ9 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cyp39a1Q9JKJ9 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cyp39a1Q9JKJ9 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cyp39a1Q9JKJ9 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cyp39a1Q9JKJ9 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cyp39a1Q9JKJ9 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cyp39a1Q9JKJ9 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cyp39a1Q9JKJ9 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cyp39a1Q9JKJ9 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cyp39a1Q9JKJ9 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cyp39a1Q9JKJ9 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cyp39a1Q9JKJ9 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cyp39a1Q9JKJ9 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cyp39a1Q9JKJ9 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cyp39a1Q9JKJ9 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cyp39a1Q9JKJ9 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cyp39a1Q9JKJ9 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cyp39a1Q9JKJ9 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Cyp39a1Q9JKJ9 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cyp39a1Q9JKJ9 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cyp39a1Q9JKJ9 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cyp39a1Q9JKJ9 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cyp39a1Q9JKJ9 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cyp39a1Q9JKJ9 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cyp39a1Q9JKJ9 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cyp39a1Q9JKJ9 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cyp39a1Q9JKJ9 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cyp39a1Q9JKJ9 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cyp39a1Q9JKJ9 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cyp39a1Q9JKJ9 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cyp39a1Q9JKJ9 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cyp39a1Q9JKJ9 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Cyp39a1Q9JKJ9 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cyp39a1Q9JKJ9 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Cyp39a1Q9JKJ9 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cyp39a1Q9JKJ9 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cyp39a1Q9JKJ9 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cyp39a1Q9JKJ9 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cyp39a1Q9JKJ9 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cyp39a1Q9JKJ9 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cyp39a1Q9JKJ9 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cyp39a1Q9JKJ9 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cyp39a1Q9JKJ9 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cyp39a1Q9JKJ9 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cyp39a1Q9JKJ9 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cyp39a1Q9JKJ9 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cyp39a1Q9JKJ9 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cyp39a1Q9JKJ9 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cyp39a1Q9JKJ9 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cyp39a1Q9JKJ9 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cyp39a1Q9JKJ9 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cyp39a1Q9JKJ9 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cyp39a1Q9JKJ9 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cyp39a1Q9JKJ9 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cyp39a1Q9JKJ9 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cyp39a1Q9JKJ9 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cyp39a1Q9JKJ9 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cyp39a1Q9JKJ9 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cyp39a1Q9JKJ9 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cyp39a1Q9JKJ9 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cyp39a1Q9JKJ9 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cyp39a1Q9JKJ9 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cyp39a1Q9JKJ9 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cyp39a1Q9JKJ9 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cyp39a1Q9JKJ9 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cyp39a1Q9JKJ9 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cyp39a1Q9JKJ9 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cyp39a1Q9JKJ9 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Cyp39a1Q9JKJ9 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms