Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKE1

Trem3, TREM-3, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem3Q9JKE1 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trem3Q9JKE1 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trem3Q9JKE1 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trem3Q9JKE1 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trem3Q9JKE1 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trem3Q9JKE1 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trem3Q9JKE1 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trem3Q9JKE1 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trem3Q9JKE1 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Trem3Q9JKE1 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trem3Q9JKE1 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trem3Q9JKE1 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trem3Q9JKE1 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trem3Q9JKE1 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trem3Q9JKE1 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Trem3Q9JKE1 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trem3Q9JKE1 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trem3Q9JKE1 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trem3Q9JKE1 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trem3Q9JKE1 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trem3Q9JKE1 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trem3Q9JKE1 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trem3Q9JKE1 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Trem3Q9JKE1 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trem3Q9JKE1 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trem3Q9JKE1 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trem3Q9JKE1 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trem3Q9JKE1 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trem3Q9JKE1 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trem3Q9JKE1 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trem3Q9JKE1 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trem3Q9JKE1 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trem3Q9JKE1 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Trem3Q9JKE1 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trem3Q9JKE1 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trem3Q9JKE1 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trem3Q9JKE1 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trem3Q9JKE1 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trem3Q9JKE1 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trem3Q9JKE1 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trem3Q9JKE1 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trem3Q9JKE1 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trem3Q9JKE1 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trem3Q9JKE1 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trem3Q9JKE1 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trem3Q9JKE1 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trem3Q9JKE1 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trem3Q9JKE1 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trem3Q9JKE1 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trem3Q9JKE1 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trem3Q9JKE1 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trem3Q9JKE1 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Trem3Q9JKE1 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trem3Q9JKE1 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trem3Q9JKE1 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trem3Q9JKE1 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trem3Q9JKE1 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trem3Q9JKE1 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trem3Q9JKE1 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trem3Q9JKE1 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trem3Q9JKE1 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trem3Q9JKE1 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trem3Q9JKE1 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trem3Q9JKE1 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Trem3Q9JKE1 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trem3Q9JKE1 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trem3Q9JKE1 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trem3Q9JKE1 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trem3Q9JKE1 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Trem3Q9JKE1 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trem3Q9JKE1 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trem3Q9JKE1 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Trem3Q9JKE1 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trem3Q9JKE1 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trem3Q9JKE1 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trem3Q9JKE1 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trem3Q9JKE1 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trem3Q9JKE1 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trem3Q9JKE1 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trem3Q9JKE1 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trem3Q9JKE1 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trem3Q9JKE1 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trem3Q9JKE1 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trem3Q9JKE1 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Trem3Q9JKE1 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trem3Q9JKE1 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trem3Q9JKE1 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trem3Q9JKE1 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trem3Q9JKE1 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trem3Q9JKE1 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trem3Q9JKE1 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trem3Q9JKE1 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trem3Q9JKE1 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trem3Q9JKE1 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trem3Q9JKE1 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trem3Q9JKE1 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trem3Q9JKE1 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trem3Q9JKE1 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trem3Q9JKE1 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trem3Q9JKE1 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms