Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK83

Pard6b, Partitioning defective 6 homolog beta, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pard6bQ9JK83 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pard6bQ9JK83 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pard6bQ9JK83 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pard6bQ9JK83 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pard6bQ9JK83 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pard6bQ9JK83 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pard6bQ9JK83 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pard6bQ9JK83 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pard6bQ9JK83 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pard6bQ9JK83 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pard6bQ9JK83 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pard6bQ9JK83 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pard6bQ9JK83 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pard6bQ9JK83 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pard6bQ9JK83 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pard6bQ9JK83 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pard6bQ9JK83 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pard6bQ9JK83 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Pard6bQ9JK83 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pard6bQ9JK83 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pard6bQ9JK83 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pard6bQ9JK83 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pard6bQ9JK83 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pard6bQ9JK83 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pard6bQ9JK83 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Pard6bQ9JK83 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pard6bQ9JK83 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pard6bQ9JK83 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Pard6bQ9JK83 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pard6bQ9JK83 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pard6bQ9JK83 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pard6bQ9JK83 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pard6bQ9JK83 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pard6bQ9JK83 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pard6bQ9JK83 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pard6bQ9JK83 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pard6bQ9JK83 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pard6bQ9JK83 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pard6bQ9JK83 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pard6bQ9JK83 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pard6bQ9JK83 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pard6bQ9JK83 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pard6bQ9JK83 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pard6bQ9JK83 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pard6bQ9JK83 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pard6bQ9JK83 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pard6bQ9JK83 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pard6bQ9JK83 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pard6bQ9JK83 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pard6bQ9JK83 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pard6bQ9JK83 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pard6bQ9JK83 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pard6bQ9JK83 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pard6bQ9JK83 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pard6bQ9JK83 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pard6bQ9JK83 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pard6bQ9JK83 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pard6bQ9JK83 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pard6bQ9JK83 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pard6bQ9JK83 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pard6bQ9JK83 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Pard6bQ9JK83 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pard6bQ9JK83 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pard6bQ9JK83 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pard6bQ9JK83 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pard6bQ9JK83 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pard6bQ9JK83 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pard6bQ9JK83 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pard6bQ9JK83 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pard6bQ9JK83 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pard6bQ9JK83 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pard6bQ9JK83 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pard6bQ9JK83 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pard6bQ9JK83 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pard6bQ9JK83 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Pard6bQ9JK83 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pard6bQ9JK83 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pard6bQ9JK83 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pard6bQ9JK83 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pard6bQ9JK83 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pard6bQ9JK83 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pard6bQ9JK83 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pard6bQ9JK83 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pard6bQ9JK83 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pard6bQ9JK83 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Pard6bQ9JK83 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pard6bQ9JK83 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pard6bQ9JK83 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pard6bQ9JK83 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pard6bQ9JK83 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pard6bQ9JK83 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pard6bQ9JK83 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pard6bQ9JK83 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pard6bQ9JK83 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pard6bQ9JK83 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pard6bQ9JK83 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pard6bQ9JK83 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pard6bQ9JK83 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pard6bQ9JK83 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pard6bQ9JK83 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms