Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJT2

Gfra4, GDNF family receptor alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra4Q9JJT2 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gfra4Q9JJT2 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gfra4Q9JJT2 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gfra4Q9JJT2 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gfra4Q9JJT2 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gfra4Q9JJT2 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gfra4Q9JJT2 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gfra4Q9JJT2 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gfra4Q9JJT2 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gfra4Q9JJT2 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gfra4Q9JJT2 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gfra4Q9JJT2 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gfra4Q9JJT2 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gfra4Q9JJT2 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gfra4Q9JJT2 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Gfra4Q9JJT2 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gfra4Q9JJT2 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gfra4Q9JJT2 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gfra4Q9JJT2 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gfra4Q9JJT2 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gfra4Q9JJT2 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gfra4Q9JJT2 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gfra4Q9JJT2 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Gfra4Q9JJT2 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gfra4Q9JJT2 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gfra4Q9JJT2 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gfra4Q9JJT2 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gfra4Q9JJT2 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gfra4Q9JJT2 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gfra4Q9JJT2 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gfra4Q9JJT2 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gfra4Q9JJT2 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gfra4Q9JJT2 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Gfra4Q9JJT2 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gfra4Q9JJT2 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gfra4Q9JJT2 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gfra4Q9JJT2 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gfra4Q9JJT2 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gfra4Q9JJT2 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gfra4Q9JJT2 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gfra4Q9JJT2 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gfra4Q9JJT2 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gfra4Q9JJT2 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gfra4Q9JJT2 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gfra4Q9JJT2 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gfra4Q9JJT2 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gfra4Q9JJT2 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gfra4Q9JJT2 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gfra4Q9JJT2 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gfra4Q9JJT2 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gfra4Q9JJT2 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gfra4Q9JJT2 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gfra4Q9JJT2 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gfra4Q9JJT2 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gfra4Q9JJT2 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gfra4Q9JJT2 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gfra4Q9JJT2 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gfra4Q9JJT2 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gfra4Q9JJT2 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gfra4Q9JJT2 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gfra4Q9JJT2 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gfra4Q9JJT2 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gfra4Q9JJT2 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gfra4Q9JJT2 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gfra4Q9JJT2 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gfra4Q9JJT2 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gfra4Q9JJT2 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gfra4Q9JJT2 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gfra4Q9JJT2 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gfra4Q9JJT2 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gfra4Q9JJT2 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gfra4Q9JJT2 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gfra4Q9JJT2 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gfra4Q9JJT2 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gfra4Q9JJT2 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gfra4Q9JJT2 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gfra4Q9JJT2 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gfra4Q9JJT2 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gfra4Q9JJT2 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gfra4Q9JJT2 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gfra4Q9JJT2 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gfra4Q9JJT2 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gfra4Q9JJT2 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gfra4Q9JJT2 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gfra4Q9JJT2 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gfra4Q9JJT2 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gfra4Q9JJT2 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gfra4Q9JJT2 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Gfra4Q9JJT2 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gfra4Q9JJT2 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gfra4Q9JJT2 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gfra4Q9JJT2 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gfra4Q9JJT2 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gfra4Q9JJT2 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gfra4Q9JJT2 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gfra4Q9JJT2 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gfra4Q9JJT2 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gfra4Q9JJT2 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gfra4Q9JJT2 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gfra4Q9JJT2 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms