Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJR7

Ascl3, Achaete-scute homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl3Q9JJR7 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ascl3Q9JJR7 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ascl3Q9JJR7 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ascl3Q9JJR7 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ascl3Q9JJR7 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ascl3Q9JJR7 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ascl3Q9JJR7 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ascl3Q9JJR7 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ascl3Q9JJR7 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ascl3Q9JJR7 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ascl3Q9JJR7 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Ascl3Q9JJR7 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Ascl3Q9JJR7 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ascl3Q9JJR7 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ascl3Q9JJR7 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ascl3Q9JJR7 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ascl3Q9JJR7 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ascl3Q9JJR7 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ascl3Q9JJR7 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ascl3Q9JJR7 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ascl3Q9JJR7 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ascl3Q9JJR7 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ascl3Q9JJR7 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ascl3Q9JJR7 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ascl3Q9JJR7 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ascl3Q9JJR7 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ascl3Q9JJR7 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ascl3Q9JJR7 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ascl3Q9JJR7 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ascl3Q9JJR7 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ascl3Q9JJR7 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ascl3Q9JJR7 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ascl3Q9JJR7 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ascl3Q9JJR7 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ascl3Q9JJR7 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ascl3Q9JJR7 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ascl3Q9JJR7 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ascl3Q9JJR7 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ascl3Q9JJR7 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ascl3Q9JJR7 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ascl3Q9JJR7 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ascl3Q9JJR7 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ascl3Q9JJR7 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ascl3Q9JJR7 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ascl3Q9JJR7 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ascl3Q9JJR7 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ascl3Q9JJR7 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ascl3Q9JJR7 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Ascl3Q9JJR7 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ascl3Q9JJR7 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ascl3Q9JJR7 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ascl3Q9JJR7 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ascl3Q9JJR7 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Ascl3Q9JJR7 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Ascl3Q9JJR7 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ascl3Q9JJR7 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Ascl3Q9JJR7 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ascl3Q9JJR7 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ascl3Q9JJR7 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ascl3Q9JJR7 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ascl3Q9JJR7 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ascl3Q9JJR7 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ascl3Q9JJR7 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ascl3Q9JJR7 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ascl3Q9JJR7 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ascl3Q9JJR7 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ascl3Q9JJR7 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ascl3Q9JJR7 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ascl3Q9JJR7 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ascl3Q9JJR7 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ascl3Q9JJR7 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ascl3Q9JJR7 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ascl3Q9JJR7 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ascl3Q9JJR7 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ascl3Q9JJR7 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ascl3Q9JJR7 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ascl3Q9JJR7 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ascl3Q9JJR7 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Ascl3Q9JJR7 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ascl3Q9JJR7 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ascl3Q9JJR7 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ascl3Q9JJR7 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ascl3Q9JJR7 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ascl3Q9JJR7 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ascl3Q9JJR7 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ascl3Q9JJR7 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ascl3Q9JJR7 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ascl3Q9JJR7 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ascl3Q9JJR7 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ascl3Q9JJR7 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ascl3Q9JJR7 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ascl3Q9JJR7 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ascl3Q9JJR7 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ascl3Q9JJR7 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ascl3Q9JJR7 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ascl3Q9JJR7 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ascl3Q9JJR7 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ascl3Q9JJR7 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ascl3Q9JJR7 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ascl3Q9JJR7 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms