Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJF6

Efcc1, EF-hand and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efcc1Q9JJF6 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Efcc1Q9JJF6 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Efcc1Q9JJF6 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Efcc1Q9JJF6 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Efcc1Q9JJF6 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Efcc1Q9JJF6 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Efcc1Q9JJF6 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Efcc1Q9JJF6 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Efcc1Q9JJF6 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Efcc1Q9JJF6 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Efcc1Q9JJF6 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Efcc1Q9JJF6 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Efcc1Q9JJF6 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Efcc1Q9JJF6 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Efcc1Q9JJF6 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Efcc1Q9JJF6 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Efcc1Q9JJF6 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Efcc1Q9JJF6 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Efcc1Q9JJF6 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Efcc1Q9JJF6 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Efcc1Q9JJF6 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Efcc1Q9JJF6 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Efcc1Q9JJF6 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Efcc1Q9JJF6 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Efcc1Q9JJF6 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Efcc1Q9JJF6 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Efcc1Q9JJF6 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Efcc1Q9JJF6 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Efcc1Q9JJF6 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Efcc1Q9JJF6 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Efcc1Q9JJF6 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Efcc1Q9JJF6 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Efcc1Q9JJF6 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Efcc1Q9JJF6 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Efcc1Q9JJF6 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Efcc1Q9JJF6 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Efcc1Q9JJF6 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Efcc1Q9JJF6 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Efcc1Q9JJF6 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Efcc1Q9JJF6 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Efcc1Q9JJF6 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Efcc1Q9JJF6 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Efcc1Q9JJF6 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Efcc1Q9JJF6 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Efcc1Q9JJF6 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Efcc1Q9JJF6 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Efcc1Q9JJF6 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Efcc1Q9JJF6 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Efcc1Q9JJF6 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Efcc1Q9JJF6 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Efcc1Q9JJF6 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Efcc1Q9JJF6 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Efcc1Q9JJF6 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Efcc1Q9JJF6 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Efcc1Q9JJF6 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Efcc1Q9JJF6 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Efcc1Q9JJF6 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Efcc1Q9JJF6 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Efcc1Q9JJF6 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Efcc1Q9JJF6 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Efcc1Q9JJF6 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Efcc1Q9JJF6 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Efcc1Q9JJF6 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Efcc1Q9JJF6 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Efcc1Q9JJF6 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Efcc1Q9JJF6 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Efcc1Q9JJF6 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Efcc1Q9JJF6 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Efcc1Q9JJF6 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Efcc1Q9JJF6 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Efcc1Q9JJF6 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Efcc1Q9JJF6 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Efcc1Q9JJF6 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Efcc1Q9JJF6 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Efcc1Q9JJF6 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Efcc1Q9JJF6 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Efcc1Q9JJF6 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Efcc1Q9JJF6 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Efcc1Q9JJF6 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Efcc1Q9JJF6 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Efcc1Q9JJF6 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Efcc1Q9JJF6 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Efcc1Q9JJF6 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Efcc1Q9JJF6 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Efcc1Q9JJF6 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Efcc1Q9JJF6 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Efcc1Q9JJF6 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Efcc1Q9JJF6 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Efcc1Q9JJF6 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Efcc1Q9JJF6 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Efcc1Q9JJF6 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Efcc1Q9JJF6 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Efcc1Q9JJF6 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Efcc1Q9JJF6 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Efcc1Q9JJF6 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Efcc1Q9JJF6 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Efcc1Q9JJF6 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Efcc1Q9JJF6 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Efcc1Q9JJF6 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Efcc1Q9JJF6 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms